| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1723413 = | 489 (0.790) | 22 (0.040) | 5/94 | NT | 5.8% | coding (70/4617 nt) | lhr | putative ATP‑dependent helicase |
| ? | CP009273 | 1723475 = | 308 (0.590) | coding (132/4617 nt) | lhr | putative ATP‑dependent helicase | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1723488‑1723413‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcgaagCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCCCTC > CP009273/1723475‑1723541 CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:21313078/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:20321549/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:8282159/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:49532050/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:220149/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:45690283/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:45418773/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:22293661/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:42509142/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:38645098/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:35204460/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:33492092/1‑68 CAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGG < 1:40542098/68‑1 CAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGG < 1:25469889/68‑1 CAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:10305491/1‑67 CAGCGCATGTTCGCGTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGG < 1:27882016/68‑1 CAGCGCATGTGCGCTTCGCGCCGCCACCTGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGG < 1:9431081/68‑1 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:25844187/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:31533949/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:43197214/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:47803271/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGG > 1:32353271/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:1724308/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:24819949/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:22624701/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:30728076/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:12445601/1‑67 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:24417612/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:13756241/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:43776943/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:13468073/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:23556644/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:40195513/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:6714181/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:11242600/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:16481643/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCG < 1:30365535/66‑1 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC < 1:25250632/65‑1 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTGAATGGCGCG > 1:20320509/1‑68 GCATGTTCGCTTCCCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:48298585/1‑68 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAA > 1:21467241/1‑68 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAA < 1:30079973/68‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAA > 1:40663705/1‑68 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:42374389/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:12584181/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:18798505/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:31015927/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:21217184/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:35547244/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:35442653/67‑1 ATGTGCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:49445975/67‑1 GTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGC < 1:462302/68‑1 TTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCGGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCa > 1:4537342/1‑67 CGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAA < 1:10141527/68‑1 CGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAA < 1:11772167/68‑1 CGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAA < 1:19104098/68‑1 CGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGGCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAA < 1:31238781/68‑1 CGCGCCGCCACCCGCCAGGTGGGCGGCGGCACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:35952874/68‑1 CGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:23307738/68‑1 CGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:18575061/68‑1 CGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:32090785/68‑1 CGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGGCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:50350652/68‑1 CGCGCCGCCACATGCCAGGTTGGCGGCTGGACAGCGGGCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACAGGC < 1:14622361/68‑1 CGCGCCGCCACATGCCAGGTGTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:22997227/68‑1 CGCGCCGCCACATCCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:8135029/68‑1 CGCGCCGCCACAAGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:35357171/68‑1 GCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCGGGACAGCGGTCGGCTGTTTAACGGCGCGAAGCGAACATGCGCT < 1:44807311/68‑1 CGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGG < 1:4857264/68‑1 CGCCACATGCCAGGGTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGG < 1:28171104/68‑1 CGCCACATCCCAGGTTTGCGGCGGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGG < 1:37114548/68‑1 CACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTACAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:39236495/67‑1 CACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:5364056/67‑1 CACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGGCGGCGGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:39266106/67‑1 CACATGCCAGGTGGGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:10194739/67‑1 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCT < 1:739154/68‑1 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCT > 1:42244510/1‑68 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCT < 1:48068900/68‑1 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCT > 1:9045742/1‑68 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTC < 1:22166412/67‑1 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTC < 1:27201739/67‑1 CGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTAC > 1:3878841/1‑68 GCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTAC < 1:3328358/67‑1 GCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTAC < 1:24745039/67‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCC < 1:46409640/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |