| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1894241 = | 433 (0.700) | 15 (0.030) | 6/90 | NT | 5.0% | coding (1558/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production |
| ? | CP009273 | 1894274 = | 219 (0.440) | coding (1591/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production | |||||
Only 100 of 763 total aligned reads displayed.
GTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCG > CP009273/1894174‑1894308 | gTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:28468591/1‑68 (MQ=255)gTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:45897729/1‑68 (MQ=255)gTACGCACAGACGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCgcccgccc > 1:27544368/1‑68 (MQ=255) tACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGcccgcccg > 1:26277068/1‑68 (MQ=255) tACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGcccgcccg > 1:35093915/1‑68 (MQ=255) tACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGcccgcccg > 1:14748340/1‑68 (MQ=255) gttgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaacg > 1:37887450‑M1/67‑68 (MQ=255) gttgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaacg < 1:47034663‑M1/2‑1 (MQ=255) gttgatcaggttcgcattgttaaagagcaaacggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaact > 1:48342090‑M1/67‑67 (MQ=255) aCGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCgg < 1:26482368/68‑1 (MQ=255) aCGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCgg < 1:25824499/68‑1 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCgg > 1:36567538‑M1/65‑67 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCgg > 1:22483616‑M1/65‑67 (MQ=255) tgatctggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCgg > 1:36110946‑M1/65‑67 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:6212960/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:2822048/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:41368979/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:8621518/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:48665554/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:20706695/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:13587791/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:31560095/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:5654895/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:15865033/68‑1 (MQ=255) cGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCCGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGc < 1:47392457/68‑1 (MQ=255) gatctggttcgcattgttaaatagcaaccgtcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCa > 1:33697917‑M1/64‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:49521165/1‑68 (MQ=255) gCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCa > 1:21567289/1‑68 (MQ=255) 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acaGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATa > 1:50177472/1‑68 (MQ=255) tggttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATAAt < 1:43793041‑M1/9‑1 (MQ=255) gCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATg > 1:42708175/1‑68 (MQ=255) ccGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:1398723/68‑1 (MQ=255) ttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATAATgg < 1:9027466‑M1/11‑1 (MQ=255) ttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATAATgg < 1:2900598‑M1/11‑1 (MQ=255) ttcgcattgttaaagagcaaccggcgcacgatgaagatgagtaagcgttaacgtaaCGGCATAATgg < 1:44683844‑M1/11‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:48124776/67‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:11092589/67‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:30102515/67‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATgg < 1:7268367/67‑1 (MQ=255) cGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGa < 1:18100816/68‑1 (MQ=255) tGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGCCat > 1:41578514/1‑68 (MQ=255) tGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACat < 1:50815420/68‑1 (MQ=255) gCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACata < 1:23982820/68‑1 (MQ=255) ccGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATTATGGACata > 1:45667615/1‑67 (MQ=255) ccGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACata > 1:20155806/1‑67 (MQ=255) ccGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACata > 1:12737948/1‑67 (MQ=255) tACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCAc > 1:49253295/1‑67 (MQ=255) tACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACg < 1:44332868/68‑1 (MQ=255) 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cccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTgcg > 1:34805292/1‑67 (MQ=255) ccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTgcgc < 1:18500610/67‑1 (MQ=255) | GTACGCACAGCCGATGCCGCTACGTGATTTTCCCAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCG > CP009273/1894174‑1894308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |