| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1894241 = | 433 (0.700) | 15 (0.030) | 6/90 | NT | 5.0% | coding (1558/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production |
| ? | CP009273 | 1894274 = | 219 (0.440) | coding (1591/1599 nt) | yoaD | putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, regulator of cellulose production | |||||
Only 100 of 751 total aligned reads displayed.
CAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACA > CP009273/1894207‑1894340 | aTGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttac < 1:26853989/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:32232746/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:8723923/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:4541/68‑1 (MQ=255) tggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacg < 1:50192702/68‑1 (MQ=255) ggctggcGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCcgttacgt > 1:41743367/1‑68 (MQ=255) acgatgaagatgagtaagcgttaacgtaacggcataatgggcgtgatatgtccattatgccgttacg < 1:50563221‑M2/5‑1 (MQ=255) tgaagatgagtaagcgttaacgtaacggcataatgggcgtgatatgtccattatgccgTTACGTTaa < 1:25638521‑M2/9‑1 (MQ=255) cGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACg < 1:21085565/67‑1 (MQ=255) aGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTAc > 1:34798450/1‑67 (MQ=255) agtaagcgttaacgtaaCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCGTACTc < 1:19398105‑M1/51‑1 (MQ=255) catccgccgCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCa < 1:15809060/64‑1 (MQ=255) cAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACt < 1:38135697/65‑1 (MQ=255) cAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCa < 1:35327251/67‑1 (MQ=255) cAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCa < 1:49775099/67‑1 (MQ=255) cAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCa < 1:31307821/67‑1 (MQ=255) aagccttaacgaaacggcataatgggcgggataggtccataaagccgTTACGTTAACGCTTACTCATc < 1:29280380‑M2/21‑1 (MQ=255) aaCCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATc < 1:44899715/68‑1 (MQ=255) cgccgcCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTc > 1:95572/1‑68 (MQ=255) gccgccCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCa > 1:42038477/1‑68 (MQ=255) cgcccgccCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCAt < 1:16129091/67‑1 (MQ=255) cccgcccgGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt > 1:3912832/1‑68 (MQ=255) cgtaaCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGt < 1:36145864‑M1/62‑1 (MQ=255) GGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCgg < 1:47078635‑M1/68‑1 (MQ=255) GGCATAATGGACATATCACGCCCATTAAGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATagtgcgcagg < 1:11819533‑M1/68‑4 (MQ=255) ATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGtt < 1:39934811‑M1/67‑1 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:29809563‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:30222873‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:5437768‑M1/1‑68 (MQ=255) 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AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:6771321‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:47463765‑M1/1‑68 (MQ=255) AATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGct > 1:19708845‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct < 1:34105778‑M1/68‑1 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct < 1:16901975‑M1/68‑1 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct < 1:18691876‑M1/68‑1 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct > 1:27609815‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGctct < 1:43658295‑M1/68‑1 (MQ=255) GGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCtt < 1:37516683‑M1/68‑1 (MQ=255) GGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCtt < 1:17928354‑M1/68‑1 (MQ=255) GGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCtt < 1:32382088‑M1/68‑1 (MQ=255) GGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCtt < 1:6378467‑M1/68‑1 (MQ=255) GGACATATCACGCCCATTATGCCGGTACGTTAACGCTGACTCATCTTCCTCGTGCGCCGGTTGCTCtt < 1:11497987‑M1/68‑1 (MQ=255) GACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCttt < 1:18480256‑M1/68‑1 (MQ=255) aCATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCttt < 1:41288167/67‑1 (MQ=255) aCATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTa > 1:32809450/1‑68 (MQ=255) aCATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTa > 1:1044805/1‑68 (MQ=255) aCATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTa > 1:22420833/1‑68 (MQ=255) aCATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTa > 1:12617154/1‑68 (MQ=255) atatCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAAc > 1:22770405/1‑68 (MQ=255) 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cgTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCaa < 1:2892834‑M2/65‑1 (MQ=255) | CAAATGGCTGGCGGGCAGCCAACCGCCGCCCGCCCGGCATAATGGACATATCACGCCCATTATGCCGTTACGTTAACGCTTACTCATCTTCATCGTGCGCCGGTTGCTCTTTAACAATGCGAACCAGATCAACA > CP009273/1894207‑1894340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |