| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 108768 = | 268 (0.740) | 14 (0.040) | 5/100 | NT | 5.7% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
| ? | CP009273 | 108799 = | 226 (0.700) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer | |||||
GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > CP009273/108799‑108864 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:18440374/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:12203865/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:9277892/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:12850770/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:23792025/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:22985441/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:14631764/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:29139322/1‑68 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:19845302/68‑1 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:10151851/68‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:14790948/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:6035386/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:19117203/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:6837251/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:7471123/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:22752922/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:9688360/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:9834991/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:28609834/1‑67 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ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:19662552/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:19547606/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:5268708/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:6700054/68‑1 ATTCAGCAGTAAACCGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:21151992/68‑1 CAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCA < 1:22551885/68‑1 cCAGATAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATTCCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAT < 1:516995/67‑1 AGTTAAACGCGGCGGGCCGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTTAATTAATGCTTCAAT < 1:4243222/66‑1 aAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTAAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:27193771/67‑1 TAAAAGCGGCGGGGAGCTTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:6541396/68‑1 cgaCGCTTTTAACTTCTGAATTAATGCTTCAATACGTCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:24116103/65‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:16829223/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:9077006/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:19253356/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:14336560/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15472757/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:19401898/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:9460261/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:23796893/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:9959665/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:27515147/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:25749492/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGGCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:14211022/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCCGG > 1:9109000/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGT < 1:26108499/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGT < 1:29079898/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:6847424/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:27979598/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATGAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:21792378/1‑67 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:6302520/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:8988253/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:29385191/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:12213418/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACCGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:6871728/1‑66 CCGCGTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCCCGCCAATCCAGG > 1:11630398/1‑66 CGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGGCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGGCT < 1:8107818/68‑1 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:6085152/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:11658635/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > CP009273/108799‑108864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |