| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 691855 = | 323 (0.900) | 46 (0.140) +TAATG |
3/102 | NT | 12.5% | intergenic (+123/+31) | ubiF/glnX | 2‑octaprenyl‑3‑methyl‑6‑methoxy‑1,4‑benzoquinol oxygenase/tRNA‑Gln |
| ? | CP009273 | 691998 = | 382 (1.060) | noncoding (75/75 nt) | glnV | tRNA‑Gln | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/691918‑691855‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG > CP009273/691998‑692064 ||||| TCCGAGGTTCGAAGCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTG < 1:8622610/68‑1 TTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGG < 1:20759016/67‑1 TTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGG < 1:8863185/66‑1 TCGAATCCTCGTACCCCACCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGGGGCTGGGGT < 1:28389832/68‑1 GCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGT > 1:977453/1‑67 cgtGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:2953787/65‑1 cgtGCTTTTTTAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:24891838/65‑1 ccAGCTTTTTTAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:9239238/66‑1 gcGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:10239554/66‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTTGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:12692164/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:17254280/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:22835811/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:16497705/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:9672009/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:3204476/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:3742934/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:21948532/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:14533077/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:6325526/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:20668846/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:15074357/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:15357522/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:14013843/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:5795356/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:13507174/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:20856550/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTG < 1:12262628/66‑1 tGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:10702930/66‑1 tCTTTTTTAATCTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCT < 1:8033731/66‑1 ggTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTT < 1:5222932/66‑1 GCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCT < 1:27617522/67‑1 GCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTT < 1:16963577/68‑1 GCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCT < 1:22314327/67‑1 CTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTT > 1:25536847/1‑67 TTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAACCAGAATCCGGTGCCTTAC < 1:25855883/68‑1 TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTA > 1:4520786/1‑67 TTTTTAATGTGGCTTGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:21232334/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:8823175/68‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCG < 1:22477063/68‑1 TTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGC < 1:3875681/68‑1 TTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAAACCGGTGCCTTACCGC < 1:16004255/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGC < 1:11885527/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:5774340/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:17049008/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGAATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:29143009/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:6523007/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:5037906/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:26559013/68‑1 aaaGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:8072966/65‑1 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:15539551/68‑1 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG > 1:16267198/1‑68 ATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGG < 1:5282801/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGACCCTCGGAATGCCGGATTCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGg > 1:7182941/1‑67 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGAATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:29412723/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:26338166/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:2603125/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTtc > 1:1145015/1‑65 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:13727310/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:10317044/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:20430897/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:10549356/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:14782840/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:8734496/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:5644404/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12274580/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:7529026/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6299463/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:13552414/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6517536/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6853611/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6891171/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12936837/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:7118002/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:7841643/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:26261924/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:19988864/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:18345813/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:22531070/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:1833879/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:23275945/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:24843002/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:17873100/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:24951422/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:25023781/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:25354137/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:16790507/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:15113694/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:26606642/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:27169077/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:27517367/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:16551670/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:27728975/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:27936353/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:28120085/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:28362822/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:29425573/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:2991540/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:3336275/1‑68 GTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG < 1:2411566/68‑1 GTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG < 1:29349735/68‑1 ||||| CATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/691918‑691855‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG > CP009273/691998‑692064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |