| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 776085 | NA (NA) | 50 (0.150) +GTT |
4/106 | NT | 10.0% | noncoding (76/76 nt) | lysT | tRNA‑Lys |
| ? | CP009273 | = 776400 | 478 (1.330) | intergenic (+26/‑124) | lysW/valZ | tRNA‑Lys/tRNA‑Val | |||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/776019‑776085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACATCTGTCTTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA < CP009273/776400‑776337 ||| GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:7618343/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:18299095/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:11137775/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:18908799/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:15393916/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:20584386/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:13735251/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:4470114/1‑68 aCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:3090299/67‑1 TCAGTTGTTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:18821154/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCTCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:11974058/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCTCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:22063685/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTa > 1:22905491/1‑67 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:23905829/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:19405301/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:24792186/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:26287317/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:21287270/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:21153394/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:4371117/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:20199031/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:4282521/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:6111944/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:6519354/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:27875045/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:27994675/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:28176314/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:29010539/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:17903017/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:13555247/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:17206041/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:13267875/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:8864217/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:14721986/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:9120626/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:11691686/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:29713719/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:2249720/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:5495073/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:4150357/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:10690887/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:6631790/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:15746586/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:20054773/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:10928530/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:2426621/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:16539366/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:18755328/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:14217531/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:135257/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:4103016/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:19850920/66‑1 TCAGTGGGTAGAGCAGTTGTCTTTTAATCTATTGGTCTCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:579071/68‑1 TCAGGTGGTAGAGCAGTTGTCTTTAAATCAATTGGTCGCATGATCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:12746046/68‑1 TCACTTGGTAGAGGAGTTGACTTTTATTCAATTGGTCGCAGGGTCTAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:17780209/67‑1 CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTT > 1:3803684/1‑68 CAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCAAGACCCACCAGTTT > 1:22223089/1‑68 AGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:10612842/64‑1 TTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:19192843/62‑1 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATTTTTAAC > 1:25452256/1‑68 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC < 1:10236410/68‑1 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC > 1:6970208/1‑68 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC > 1:26396704/1‑68 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC > 1:16011639/1‑68 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA > 1:21906146/1‑68 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA > 1:26121598/1‑68 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:14757366/62‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATa > 1:12315483/1‑67 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:11802732/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:15902219/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:5599613/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:630870/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:25005546/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:22472573/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:9928752/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:8241746/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:3578426/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:8747245/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:29242599/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:13155886/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:14261759/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:16539373/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:18435262/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:19562344/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:1982412/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:23642577/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:24022269/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:29475759/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGCTTTAACtta > 1:16720784/1‑65 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAT‑CTGCACGCCCCCCCAGTTTTAACATCc > 1:17445131/1‑67 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTAGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:510567/1‑68 GAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCTa > 1:28460085/1‑67 CAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA < 1:23048331/61‑1 CAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA < 1:2784518/61‑1 TTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA > 1:27249341/1‑52 TTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:21838432/36‑1 TTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:26822786/36‑1 CGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC < 1:10404524/37‑1 TCGAAGCCTGCACGACCCACCAGTTTTACCATCTGGCATCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGG < 1:19044178/67‑1 AGTTTTAACATCTGTCTTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA > 1:15066699/1‑68 ||| GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/776019‑776085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACATCTGTCTTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA < CP009273/776400‑776337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |