New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3015939 | 429 (1.190) | 29 (0.090) | 12/96 | NT | 7.3% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
? | CP009273 | = 3015996 | 366 (1.190) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3015865‑3015939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccaACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGTA < CP009273/3015996‑3015930 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:15998657/1‑68 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATAGTCTGGTTATCCACGCCTCCAACAAGGTACCATGGCACTTAC > 1:1916786/1‑68 TGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:27569245/1‑67 TGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:4607255/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTCCCATGGCACTTACG > 1:26668541/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:13523799/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:1590643/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:22017357/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:24499522/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:13389577/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:26407014/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:25387097/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:7865511/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCAACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:24560093/1‑67 GCTTTACTCGTATGGA‑GGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:5960392/68‑1 CTTTACTCGTATGGAGGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCATGTACCATGGCACTTACGCC < 1:23205313/68‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGTTCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:4270422/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACGATGGCACTTACGCC > 1:20118304/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:19876710/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:24989853/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:261753/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:2099492/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:4518579/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:22003885/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:25940592/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:25580089/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:22006850/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:22189966/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:23982349/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:24474864/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:25574572/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:27098507/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:3430645/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:3284368/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:3225148/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:5148239/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:9655877/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11281548/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:11283130/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:8894867/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11859486/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:12288365/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:12537930/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:6696594/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:12920622/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:6515618/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:13523342/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:14217554/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:14348001/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:5847374/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:1495609/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:15201364/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:15313066/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:15407913/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:155802/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:5507624/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:5183829/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:19700/1‑67 TTTACTCGTAAGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:29527914/67‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:12829724/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:16855733/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:5339120/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:9761398/68‑1 ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:10711446/1‑68 ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:10746723/1‑68 ACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:19383401/54‑1 GGTTATCCACGCCTCCACCCCGGTACCATGGCACTTACGCCGCCCACTCGCTCGGTAATGACAGGA > 1:7064216/1‑66 GGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCCACTCGCGGGTTAATGACAGGAAC > 1:27955678/1‑68 GGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCACCTCGCGCTTTAATGACATGA > 1:11359676/1‑66 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCACCTCGCTCTGTAATGCCATGTACTTTTTGCGGTTTCATGC > 1:5467598/1‑67 GGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCAC > 1:28566847/1‑68 GTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTTTGCTGTTTCATGCCCACG > 1:14889259/1‑68 TACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGA > 1:13126490/1‑68 TACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCA < 1:24807343/65‑1 TACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCGCTTTAATGCGATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCCCGA > 1:28293385/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCCACTCGCTCTTTAATGACATGACCTTTTTGCTGTTTCATGGCCCCGAG > 1:28988998/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAAGTCGCTCTTTAATGACATGCACGTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:2692669/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:13084668/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:16665195/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:27874939/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:18281134/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:20137668/1‑68 TGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:27156533/1‑68 TGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:24719741/1‑68 GGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:24701788/1‑67 GGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:2984193/1‑67 GGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:12613318/1‑67 gaACTTGCGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGCACTTTATGCTGTTTCATGGCCTGGAGGCGCGC > 1:21568327/3‑68 ACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCCCGCGGCGCGCGACCTG > 1:3120396/1‑68 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:9486982/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACATTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:28311559/68‑1 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC > 1:11986055/1‑68 CGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGG < 1:22944942/68‑1 CGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCG > 1:9207698/1‑67 CGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCG < 1:27257114/67‑1 CGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCG < 1:17762206/67‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:816709/68‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:10253682/68‑1 CAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCG < 1:25054350/67‑1 AACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGGTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGTA < 1:27441188/68‑1 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3015865‑3015939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccaACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGTA < CP009273/3015996‑3015930 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |