| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3015939 | 429 (1.190) | 29 (0.090) | 12/96 | NT | 7.3% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| ? | CP009273 | = 3015996 | 366 (1.190) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding | |||||
Only 100 of 544 total aligned reads displayed.
ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 | aCTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:10746723‑M1/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:20308575/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:1750607/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:5412232/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:24237226/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCAATTACGCCGCCAgg > 1:6590337/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGt < 1:19342876/68‑1 (MQ=255) tATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCCGGTc > 1:25687757/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg < 1:14105623/67‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:19674014/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:20986241/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:23665552/68‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCTGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:2586136/67‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:25485123/67‑1 (MQ=255) gATCGGCTGGGTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCAGTTACCCCGCCAGGTCGCGCGCCTCg < 1:8060862/67‑1 (MQ=255) tCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTgg < 1:9036910/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:22666494/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:19061597/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:21347640/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:11903130/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:27964525/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:13162393/68‑1 (MQ=255) gTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa > 1:27678142/1‑68 (MQ=255) gTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGa > 1:4273934/1‑67 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:13678017/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:10499423/67‑1 (MQ=255) tATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAAc > 1:14620811/1‑68 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:9346719/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:28366213/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:14813485/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:11535924/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:11300586/68‑1 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:5225507/1‑68 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:12827024/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt > 1:29238699/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt > 1:18475893/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt > 1:3662551/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:16810947/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:9481651/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:5667600/1‑68 (MQ=255) cTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa < 1:2654333/67‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGTCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:13273560/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:13058722/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:5034956/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:15819079/68‑1 (MQ=255) ccACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGtt < 1:7298885/68‑1 (MQ=255) aCCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCCGGTCCCGCGCCTCGTGGGCATGCAACCGCATAACGTGCa > 1:27060269/1‑68 (MQ=255) aCCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgccatgaactttatgctgtttcat > 1:21982227‑M1/1‑29 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCATGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:20079790/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATTAAGTTCATg > 1:24938286/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg < 1:313722/68‑1 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:14980335/1‑68 (MQ=255) gTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt > 1:26182322/1‑68 (MQ=255) tACCATGTCACTTAAGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:7664662/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttgatgccca < 1:28129696‑M1/65‑44 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:8762566/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:4642392/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:23517480/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:24677747/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:17118236/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAtt > 1:23322975/1‑68 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:10012365/67‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:1225213/67‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:3955883/67‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:22230182/67‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:21586859/67‑1 (MQ=255) gaCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:28218119/66‑1 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCCactcgctctttaatgacatgacctttttgctgtttcatggccccgag > 1:28988998‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAagtcgctctttaatgacatgcacgttatgctgtttcatgcccacgag > 1:2692669‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgag > 1:27874939‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgag > 1:18281134‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAATGTGCATGTCATTa > 1:8196757/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAtt < 1:24748962/67‑1 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:25078196/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:11085797/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:711278/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:5925243/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:15437816/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:17776738/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:18940593/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:3085783/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCAGGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:5481406/1‑68 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAag > 1:16335633/1‑68 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAag > 1:1990376/1‑68 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:4775372/1‑67 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:13778804/1‑67 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:9707273/1‑67 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:6827627/1‑67 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGCTCGCGCGCCGCGTGGGCATGAAACAGCATTAACTTCATGACATTAAaga > 1:6224556/1‑67 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGCGCGa > 1:28778420/1‑68 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGa > 1:23909648/1‑68 (MQ=255) cTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAg < 1:20535982/68‑1 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:9833277‑M2/68‑5 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:29790945‑M2/68‑5 (MQ=255) ccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcg < 1:22944942‑M2/68‑6 (MQ=255) cgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcg < 1:27257114‑M2/67‑6 (MQ=255) gccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggc < 1:10253682‑M1/68‑65 (MQ=255) cAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcgt < 1:12567642‑M1/68‑67 (MQ=255) aactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcgta < 1:16603311‑M1/68‑68 (MQ=255) aactcgctctttaatgacatgaactttatgctggttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcgta < 1:27441188‑M1/68‑68 (MQ=255) | ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |