| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2707629 = | NA (NA) | 6 (0.020) +TTC |
4/106 | NT | NA | intergenic (+40/+169) | srmB/yfiE | ATP‑dependent RNA helicase/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | CP009273 | = 3323920 | NA (NA) | intergenic (+165/+21) | dacB/obgE | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase/GTPase involved in cell partioning and DNA repair | |||||
Only 100 of 569 total aligned reads displayed.
CGTGCCACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTT > CP009273/2707562‑2707695 | cGTGCCACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGc > 1:21654063/1‑68 (MQ=255) cACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAAc > 1:14034245/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAAc > 1:27461805/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACg < 1:1456610/68‑1 (MQ=255) aCCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGc > 1:17249939/1‑68 (MQ=255) gCAGACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCaaa < 1:12875184/68‑1 (MQ=255) aaaCGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCaaa > 1:21891723/1‑66 (MQ=255) aaaCGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAAc < 1:11501832/68‑1 (MQ=255) aCGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACt > 1:20908264/1‑67 (MQ=255) aCGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACt > 1:26806692/1‑67 (MQ=255) cGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGc < 1:29384698/68‑1 (MQ=255) aCAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAACCGCAAAACTg > 1:22146986/1‑65 (MQ=255) aCAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTg > 1:27069101/1‑65 (MQ=255) aCAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTg > 1:20400104/1‑65 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:2026241/1‑68 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:22619527/1‑68 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc < 1:14271594/68‑1 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:7876300/1‑68 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc < 1:19899394/68‑1 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc < 1:15355622/68‑1 (MQ=255) agTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:11191240/1‑66 (MQ=255) agTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:28568069/1‑66 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:21418176/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:8570359/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:19623645/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:4898962/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:9434175/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:408351/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc > 1:15130832/1‑68 (MQ=255) tctcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc > 1:27662548/1‑66 (MQ=255) ctcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCt > 1:22980246/1‑68 (MQ=255) cgtaggcctgataagcgtagcgcatcaggcggctgaaCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCtt < 1:27918292‑M1/31‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCGTTGTATTAAAATTGCGGGCAAACGCAATACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:17151540/68‑1 (MQ=18) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:26416094/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:26182879/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:11369865/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:14857569/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:8037636/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:17974793/68‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg < 1:19052236/68‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg < 1:28106419/68‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg > 1:6316113/1‑68 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg < 1:10957990/68‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg < 1:15977645/68‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg > 1:8950652/1‑68 (MQ=255) cctgataagcgtagcgcatcaggctgatgaaCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg < 1:23498405‑M1/36‑1 (MQ=255) ccAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg > 1:17583554/1‑67 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:3014075/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:12565610/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:13917886/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:28310765/67‑1 (MQ=255) aGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg > 1:9268813/1‑66 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCt < 1:19988202/66‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa < 1:1268511/67‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc > 1:25158190/1‑68 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc > 1:16526609/1‑68 (MQ=255) ttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACTCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc < 1:4521256/67‑1 (MQ=255) ttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc < 1:12247166/67‑1 (MQ=255) aGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTgg < 1:10007455/68‑1 (MQ=255) aGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGACTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTgg < 1:28884620/68‑1 (MQ=255) gCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 1:25303302/1‑66 (MQ=255) gCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 1:19332822/1‑66 (MQ=255) gCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 1:8236415/1‑66 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc > 1:22517599/1‑67 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc > 1:10815000/1‑67 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc > 1:549864/1‑67 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc > 1:18507486/1‑67 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc > 1:29731651/1‑67 (MQ=255) cTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc < 1:29272937/66‑1 (MQ=255) cTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCt < 1:23853237/67‑1 (MQ=255) ggTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCAt < 1:12059504/68‑1 (MQ=255) gTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATg < 1:7056684/37‑1 (MQ=255) tATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATg < 1:10326998/67‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGc < 1:15659653/67‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGc < 1:4365554/67‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCa > 1:25905545/1‑68 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCa > 1:16387739/1‑68 (MQ=255) ttAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCaa < 1:3867488/68‑1 (MQ=255) ttAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCaa < 1:15817121/68‑1 (MQ=255) tAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAat < 1:18816499/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:3268409/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:5588272/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:718804/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:6562271/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:21085695/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCTAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:593693/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAACCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:18246447/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:24849212/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:8335257/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:20671762/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:17405341/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:3738425/68‑1 (MQ=255) aaaCTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:24266512/68‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:9759552/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:25625456/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:11881200/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:10175987/1‑68 (MQ=255) aGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatatat > 1:16890642/1‑68 (MQ=255) gCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGa > 1:7495461/1‑68 (MQ=255) cAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAAttt > 1:13071566/1‑67 (MQ=255) | CGTGCCACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTT > CP009273/2707562‑2707695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |