| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3851553 = | 461 (0.980) | 41 (0.110) | 10/86 | NT | 12.0% | coding (212/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3851602 = | 248 (0.680) | coding (163/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein | |||||
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
GCCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3851632‑3851553‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtccggcccgtgCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACTATC > CP009273/3851602‑3851668 CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG > 1:19386697/1‑68 CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCGACGCTAACCAG > 1:21570688/1‑68 cttCACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:19763251/64‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT < 1:17770651/68‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:20306312/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:22622246/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:35479759/67‑1 CACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:7377706/1‑68 CACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:36678201/1‑68 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:32047770/68‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:6811649/1‑67 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCG > 1:14589305/1‑67 ACCTGTTCACCGGATTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:18537762/68‑1 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:32593059/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:2337117/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:24305889/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:32413015/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:34348752/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:3559559/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:5913680/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:8863358/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:9183951/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:10689065/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGAATATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:16134820/1‑67 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:3139354/68‑1 TCACGGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:26737188/67‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:9279696/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:6141692/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:6643059/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:15278105/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:14059239/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACAGGTATCTACGCTAACCAGTCACGCCCGTc > 1:17473978/1‑67 TCACCGGTTTGTACGCCTGCAAGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:28037817/67‑1 TCACCGGATTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATATACGGGTATCTACGCTAACCCGTCCGGCCCGa < 1:4652539/67‑2 ACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTtg > 1:16495872/1‑65 CGGTTTGTCCGCCTCCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:2009307/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTCCGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:29436500/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCCGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:1319928/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:12883881/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:25167315/68‑1 CGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:14791034/68‑1 CGGTGTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTACCCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:3508305/68‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:16818230/67‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:29764162/67‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:13915610/67‑1 tcGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTAACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGT < 1:25379138/65‑1 GCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACC < 1:16641594/68‑1 TGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTCCGCTAACCACCCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGT < 1:310530/68‑1 cCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGT < 1:795618/66‑1 CACGGGCCGGACTATTAACCGCAATCAACGCTAACCAGCCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGA < 1:25974908/68‑1 ACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGCCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGA < 1:22112190/67‑1 ACGGGCCGGACAATTTACCGGTATCTACGCACACCCGGCCGGCCCGGGCAGGCGTACAAACCGGTGA < 1:15474649/67‑1 GGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAG > 1:5264224/1‑68 CCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCACTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:27254308/67‑1 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:25560892/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:20010174/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:37011665/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:28970155/1‑67 GTCCGGCCCGTGCTGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC > 1:23738708/1‑68 GTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC > 1:27601445/1‑68 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCTGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCag > 1:19838721/1‑65 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:29632429/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:10946174/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:3927800/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:270248/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:33842939/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:34791314/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:24582405/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGAACAAAACGGTGAACAGGTGTAGGAGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:1207106/1‑67 GGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCA > 1:22312830/1‑68 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:23136536/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG < 1:12585895/67‑1 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:13114528/1‑67 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |