| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3888593 | 350 (0.740) | 18 (0.050) | 7/88 | NT | 5.2% | intergenic (+15/+39) | chrR/purP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter |
| ? | CP009273 | = 3888604 | 381 (1.030) | intergenic (+26/+28) | chrR/purP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter | |||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
GCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3888515‑3888593‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaacccgccaTGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAATGCGGTCA < CP009273/3888604‑3888538 GCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAA > 1:3054263/1‑68 CTGGACCCCCTGACCGGGCAATTGCCCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:2726662/1‑68 CTGGACCACCTGCCCGGGCAATTGCCCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:5998351/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAGATAAA > 1:7172110/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:25405472/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:29470520/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:29427990/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:27841358/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:2770228/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:26469992/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:26071388/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:2565445/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:29884219/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:25201066/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:24738656/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:23752112/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:22373162/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:22227002/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:21771120/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:29669250/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:10233954/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:31010034/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:31810495/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:35426958/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:367860/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:37616063/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:3825887/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:38436278/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:38650455/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:38809198/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:4617823/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:690918/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:9194835/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:9649118/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:21022335/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:14073151/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:13685707/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:14498979/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:16604656/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:13259298/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:18076609/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:18618971/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:12025918/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:10855181/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:1187261/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:11668279/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTAAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:2025455/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGCTGAGTTTATTCATCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:5481061/1‑68 CTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACAGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAA > 1:33451646/1‑68 TGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAA > 1:27513766/1‑68 GGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAA > 1:19957164/1‑68 GGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAA < 1:37984253/68‑1 GGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAA > 1:37238423/1‑68 GGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAA > 1:15605220/1‑68 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTGAGATCTAAATAAAAAA > 1:19526350/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:24261596/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:30361952/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:32492678/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:32920065/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:35753629/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:2849772/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:28131718/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:1291722/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:17447885/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:26830319/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:18817219/1‑67 ACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAA > 1:24479359/1‑67 CCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAAC > 1:2143534/1‑67 CCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAAC > 1:31531545/1‑67 CCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAAC > 1:1841837/1‑67 ACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCG < 1:29930144/68‑1 ACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCC > 1:10889266/1‑67 CTGACCGGGCTATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATATAAATAAAAAACCCGCC > 1:19783513/1‑68 CTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCC > 1:30175529/1‑68 CTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCC > 1:1261181/1‑68 CTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCC > 1:33844698/1‑68 CTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCC > 1:15939641/1‑68 CTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCC > 1:22954333/1‑68 CTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCC > 1:17107136/1‑68 TGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCA < 1:20366951/68‑1 ACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTAAGCGAGTTAACATCTAAATAAAAAACCCGCCAcc > 1:7804177/1‑66 CCGCATTTGGTGAGTTTATACAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCATGCATGATTGCTGGC > 1:6665318/1‑68 TGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCATGCATGATTGCGGGCGGGTTTTTTA > 1:10632201/1‑68 TGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCATGCATGAGTGCTGGCGGGGTTTTTA > 1:39100267/1‑68 TCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCT > 1:2912871/1‑68 AAAAACCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACC > 1:10084218/1‑68 AACCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAA < 1:20628674/68‑1 AACCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAA > 1:37366584/1‑68 ACCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAAT > 1:13495192/1‑68 ACCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAAT > 1:32976846/1‑68 ACCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAAT > 1:11296953/1‑68 CCCGCCATGCATGATTGGTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAAT > 1:3646995/1‑67 CCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAAT > 1:12759430/1‑67 CCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAAT > 1:4990128/1‑67 CCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAAT > 1:16802216/1‑67 CCCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACAAAAT > 1:14828472/1‑67 CCGCCATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAATGC > 1:36003465/1‑68 CATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAATGCGGTC < 1:23370951/68‑1 CATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAATGCGGTC < 1:30738938/68‑1 ATGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAATGCGGTCA < 1:7532590/68‑1 GCTGGACCACCTGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3888515‑3888593‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaaacccgccaTGCATGATTGCTGGCGGGTTTTTTATTTAGATCTTAACTCGCTGAATAAACTCACCAAATGCGGTCA < CP009273/3888604‑3888538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |