| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3888593 | 350 (0.740) | 18 (0.050) | 7/88 | NT | 5.2% | intergenic (+15/+39) | chrR/purP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter |
| ? | CP009273 | = 3888604 | 381 (1.030) | intergenic (+26/+28) | chrR/purP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter | |||||
Only 100 of 583 total aligned reads displayed.
TGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCA > CP009273/3888526‑3888660 | tGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCA < 1:252920‑M1/68‑1 (MQ=255) aCCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGc > 1:24771544/1‑68 (MQ=255) aCCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGc > 1:635870/1‑68 (MQ=255) ccGGGCAATTGACCGCATTTGGTGTTTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCa < 1:447785/68‑1 (MQ=255) ccGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCa < 1:20702009/68‑1 (MQ=255) ccGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCa < 1:22346596/68‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCaa > 1:27590017/1‑67 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt < 1:12942931/68‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt < 1:15003147/68‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt < 1:29983400/68‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt < 1:12432706/68‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt < 1:12056724/68‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt < 1:4238053/68‑1 (MQ=255) gggCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAAt < 1:9718448/68‑1 (MQ=255) cAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATca < 1:35443552/67‑1 (MQ=255) aaTTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATcatg < 1:30231471/68‑1 (MQ=255) aaTTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATcatg < 1:4893413/68‑1 (MQ=255) tGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAt < 1:38221673‑M2/68‑2 (MQ=255) ccGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggc > 1:26376379‑M2/1‑64 (MQ=255) gCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgg > 1:36003465‑M2/1‑62 (MQ=255) gCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgg < 1:35802403‑M2/68‑7 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAtgcatgattgctggcgggt > 1:7686921‑M1/1‑49 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggt > 1:10208601‑M2/1‑60 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggt < 1:31148644‑M2/68‑9 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggt < 1:7041557‑M2/68‑9 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggt > 1:11489434‑M2/1‑60 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcggg > 1:27794775‑M2/1‑60 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAtggatgattgctggcgggtttttta > 1:37710408‑M1/1‑43 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAtgcatgagtgctggcggggttttta > 1:39100267‑M1/1‑43 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:29565626/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:16393539/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:2663137/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:31613871/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:14247411/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:29233743/1‑67 (MQ=255) aGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAc > 1:21933211/1‑67 (MQ=255) aGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAc > 1:10723497/1‑67 (MQ=255) ttATTCAGCGAGTTAAGATCTAAAT‑AAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:25658732/68‑1 (MQ=255) tATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:34216616/68‑1 (MQ=255) tATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:23909294/68‑1 (MQ=255) tATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:11722754/68‑1 (MQ=255) tATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:15893122/68‑1 (MQ=255) ttCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTa > 1:5660052/1‑67 (MQ=255) ttCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTa > 1:37930555/1‑67 (MQ=255) ttCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTAt < 1:27179167/68‑1 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAtgcatgattgctggcgggttttttttttagatct > 1:2313875‑M1/1‑34 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATc > 1:28647911/1‑68 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATc > 1:5051901/1‑68 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATc > 1:16163045/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:33496095/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:35045749/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:5876073/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg < 1:10532970/68‑1 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg < 1:38740255/68‑1 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:14700386/1‑68 (MQ=255) cGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAtt > 1:34642303/1‑68 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATTGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:26022447/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:1390790/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:36568325/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:5282494/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:1533330/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:18626936/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:24328091/66‑1 (MQ=255) tAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAg < 1:20219913/67‑1 (MQ=255) caaGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTCAACGCGCTATCGATTTTAg < 1:7374686/66‑1 (MQ=255) aTCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc > 1:21583427/1‑68 (MQ=255) aTCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc > 1:20541083/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:26985372/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:19009030/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:8105777/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:16835545/1‑68 (MQ=255) aataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGa < 1:16931248/68‑1 (MQ=255) aataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGa < 1:36257465/68‑1 (MQ=255) ataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGAt > 1:6765133/1‑68 (MQ=255) ataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGAt > 1:1112798/1‑68 (MQ=255) aaaaacacCCGCCCCCAACCAACCAtggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactca > 1:3838217‑M2/2‑25 (MQ=255) aaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGAc < 1:9151993/68‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGAc < 1:28775182/68‑1 (MQ=255) aCCCGCCAtgcatgattgctggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaat > 1:11296953‑M1/1‑8 (MQ=255) aCCCGCCAtgcatgattgctggcggggtttttatttagatcttaactcgctgaataacctcaccaaag > 1:32605990‑M1/1‑8 (MQ=255) aCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACa > 1:1190612/1‑68 (MQ=255) aCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACa > 1:32253854/1‑68 (MQ=255) cccGCCAtgcatgattgctggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaat > 1:12759430‑M1/1‑7 (MQ=255) cccGCCAtgcatgattgctggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaat > 1:16802216‑M1/1‑7 (MQ=255) cccGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACaa > 1:13439899/1‑68 (MQ=255) ccGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAAt < 1:1955983/68‑1 (MQ=255) gCCAtgcatgattgctggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaatgcgg < 1:36897789‑M1/68‑65 (MQ=255) gCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACCATCt < 1:8481953/68‑1 (MQ=255) gCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCt < 1:10069279/68‑1 (MQ=255) 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atgcatgattgctggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactcaccaaatgcggtca > 1:19814695‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGACCGGGCAATTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCA > CP009273/3888526‑3888660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |