| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3888593 | 350 (0.740) | 18 (0.050) | 7/88 | NT | 5.2% | intergenic (+15/+39) | chrR/purP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter |
| ? | CP009273 | = 3888604 | 381 (1.030) | intergenic (+26/+28) | chrR/purP | chromate reductase, Class I, flavoprotein/adenine permease, high affinity; adenine:H+ symporter | |||||
Only 100 of 544 total aligned reads displayed.
TTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGC > CP009273/3888537‑3888671 | ttGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATcatgca < 1:12225330/68‑1 (MQ=255) gACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtg < 1:30738938‑M2/68‑3 (MQ=255) gACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtg < 1:18419605‑M2/68‑3 (MQ=255) aTTTTGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcggg > 1:14828472‑M2/1‑60 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCACTCATGCAtggcggg > 1:20659992‑M2/1‑60 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggt > 1:32976846‑M2/1‑60 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCAtggcggg > 1:11281919‑M2/1‑60 (MQ=255) aTTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCACCAATCATGCAtggcggg > 1:3646995‑M2/1‑60 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:2663137/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:16393539/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:1967566/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:22199735/1‑67 (MQ=255) tGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTa > 1:14247411/1‑67 (MQ=255) aGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAc > 1:11892582/1‑67 (MQ=255) aGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAc > 1:10723497/1‑67 (MQ=255) tttATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAcgc > 1:3868520/1‑67 (MQ=255) ttATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAcgc > 1:20373230/1‑66 (MQ=255) ttATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAAcgc > 1:33522431/1‑66 (MQ=255) tATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:34216616/68‑1 (MQ=255) tATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCt < 1:12792501/68‑1 (MQ=255) ttCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTa > 1:34937836/1‑67 (MQ=255) ttCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTa > 1:29629464/1‑67 (MQ=255) ttCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTAt < 1:27179167/68‑1 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATc > 1:23935851/1‑68 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATc > 1:24349565/1‑68 (MQ=255) tCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATc > 1:12050903/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:7200057/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg < 1:35715702/68‑1 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:8165499/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:12631158/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:1679804/1‑68 (MQ=255) cAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCg > 1:29356227/1‑68 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:1935100/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:15211152/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:1390790/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:18626936/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:11536690/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:25249944/66‑1 (MQ=255) gAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGAt < 1:30194733/66‑1 (MQ=255) gATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCTATCGTGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGa > 1:19022885/1‑67 (MQ=255) gATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGa > 1:4391632/1‑67 (MQ=255) aTCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc > 1:21583427/1‑68 (MQ=255) aTCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc > 1:37641424/1‑68 (MQ=255) aTCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc > 1:770299/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCTGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc < 1:19827353/67‑1 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGc < 1:17469615/67‑1 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:16905000/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:38878460/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:26318882/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:26985372/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:5988371/1‑68 (MQ=255) tCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCg > 1:13618392/1‑68 (MQ=255) taaataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTc < 1:568544/68‑1 (MQ=255) aataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGa < 1:2118062/68‑1 (MQ=255) aataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGa < 1:38465240/68‑1 (MQ=255) aataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGa < 1:15780937/68‑1 (MQ=255) aataaaAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGa < 1:36257465/68‑1 (MQ=255) taaaAACCCCGCCAGCAATCATCCAtggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactca > 1:5055374‑M2/1‑25 (MQ=255) taaaaacCCGCCAGCAATCATGCAtggcgggttttttatttagatcttaactcgctgaataaactca > 1:27678884‑M2/2‑24 (MQ=255) aaaaaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATaaa < 1:4651224/68‑1 (MQ=255) aaaaaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATaaa < 1:17255638/68‑1 (MQ=255) aaaCCCGCCAGCAATCATGC‑TGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGAc < 1:2865767/68‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGAc < 1:37877480/68‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGAc < 1:37222770/68‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGAc < 1:28775182/68‑1 (MQ=255) aCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACa > 1:32253854/1‑68 (MQ=255) aCCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACa > 1:3687940/1‑68 (MQ=255) cccGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACaa > 1:3050188/1‑68 (MQ=255) cccGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACaa > 1:10444015/1‑68 (MQ=255) ccGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAAt < 1:21869360/68‑1 (MQ=255) cGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATc < 1:6803904/68‑1 (MQ=255) gCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCt < 1:1684383/68‑1 (MQ=255) gCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCt < 1:10069279/68‑1 (MQ=255) gCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAg > 1:9578691/1‑68 (MQ=255) aaTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAgg < 1:23461643/67‑1 (MQ=255) aaTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAgg < 1:31689253/67‑1 (MQ=255) aaTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGa < 1:35244929/68‑1 (MQ=255) aaTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGa < 1:7391813/68‑1 (MQ=255) aaTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATATTCAgg < 1:5335141/67‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 1:23049803/68‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 1:10226476/68‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 1:13390460/68‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 1:33335551/68‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 1:34716065/68‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 1:24712216/68‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGAt < 1:25898103/68‑1 (MQ=255) aTCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTAAGGAt > 1:14636411/1‑68 (MQ=255) catgcatgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATaa < 1:8633083/68‑1 (MQ=255) gcatgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTTGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAca > 1:31269717/1‑68 (MQ=255) gcatgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAca > 1:28379952/1‑68 (MQ=255) gcatgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAca > 1:6509156/1‑68 (MQ=255) gcatgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAca > 1:11040584/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGTGCGTCGATAAACAAAAACTTCAGGATAAAcagc > 1:34553972/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAccgc > 1:16110231/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:25567477/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:29058450/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:38180089/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:17894004/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:35925453/1‑68 (MQ=255) atgGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAAcagc > 1:8963816/1‑68 (MQ=255) | TTGACCGCATTTGGTGAGTTTATTCAGCGAGTTAAGATCTAAATAAAAAACCCGCCAGCAATCATGCATGGCGGGTTTTTAACGCGCTATCGATTTTAGTGAGCGTCGATAAAGACAATCTTCAGGATAAACAGC > CP009273/3888537‑3888671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |