New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3999963 | 590 (1.250) | 25 (0.060) | 6/98 | NT | 5.7% | coding (740/1830 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
? | CP009273 | = 4000007 | 307 (0.740) | coding (784/1830 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
CCGCTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3999890‑3999963 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcgcTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA < CP009273/4000007‑3999942 CCGCTCGATCAGTTGATGCTCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAG > 1:13063991/1‑68 GCTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCC < 1:28153919/68‑1 CTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCC > 1:12382229/1‑67 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:21587017/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:33558519/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:37565943/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:18774323/68‑1 TCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGGTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCT > 1:15547328/1‑67 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTGTACTTTCG > 1:25308901/1‑68 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTATTTTC > 1:27065808/1‑67 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTa > 1:21585172/1‑66 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTC > 1:6028622/1‑67 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTC > 1:35795607/1‑67 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTC > 1:6856401/1‑67 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGGGGTGGCTTCTCGTTTCGCGCG > 1:23732606/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:6956519/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGGCTTCGACTTTCGCGCG > 1:15257133/1‑68 CTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:17357358/1‑67 CTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:23444442/1‑67 ACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:36155620/1‑65 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:35214840/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:33610423/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:22408185/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:22151883/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:19467627/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:20869365/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:19924995/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:16396796/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:9594147/1‑68 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GCCGCGCTAATT‑CCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:9869024/68‑1 CCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:4764948/1‑68 CCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:18526650/1‑68 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGTCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:31432628/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:35209077/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:27770237/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:35008130/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:4345532/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA > 1:4804221/1‑68 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:661625/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA > 1:7146628/1‑68 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:7774528/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:8225004/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA > 1:966503/1‑68 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:33914445/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:11956112/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:15521213/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:15811572/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:2059301/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:21288706/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:23629304/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:24393387/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:25064622/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:26450867/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:26803187/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA > 1:3386247/1‑68 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:2924696/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA > 1:28352200/1‑68 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:10786625/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:34561015/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:35178346/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:33435002/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:2310768/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:24543807/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:26102187/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:5650683/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:5305609/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:27137674/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGGGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:23249439/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTCTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:37872540/67‑1 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTTGATAA > 1:33584799/1‑68 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:15383307/1‑68 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:13045459/1‑68 CCGCTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3999890‑3999963 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcgcTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA < CP009273/4000007‑3999942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |