New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 108768 = | 322 (0.680) | 27 (0.060) | 7/100 | NT | 8.1% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
? | CP009273 | 108799 = | 329 (0.780) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGG > CP009273/108799‑108865 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC < 1:28988753/68‑1 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC < 1:11736048/68‑1 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:8526101/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:13151358/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:28231637/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:29374663/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:36216118/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:2796341/1‑68 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:17287518/68‑1 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:36864177/68‑1 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:38741988/68‑1 GACCAGAGCCGTATTGCAGCATTAATTCCGCCGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:33626235/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:31378129/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:18855990/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:31677023/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:28267060/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:29212547/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:36258275/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:7061247/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:15102920/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:14942878/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:21534904/67‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTACTTCAGCAGTTAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:15808304/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:24612333/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:35565087/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:28546548/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:31310660/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:10735618/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:6884589/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:7926977/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:9001568/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:16994144/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCG < 1:18584017/67‑1 GTATTGAACCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACT < 1:5101493/68‑1 ATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAAATTCCGCGCCGCTTTTAACTGC < 1:9063186/68‑1 GAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGA < 1:16466700/68‑1 AGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAA < 1:9440346/67‑1 AGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAA < 1:16030741/67‑1 AGCATTAAATCAGCAGTTAAAAGCCGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAA < 1:35456653/67‑1 aaTCAGCCGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:15629600/66‑1 ATTCAGCAGTTACAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTACTGCT < 1:8535926/68‑1 ATTCAGCAGTTAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:16198813/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:27652876/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:37307543/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:39049805/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:33812685/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:23153361/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:5228122/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:19715290/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:7316392/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:18669054/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:28413695/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:19671367/68‑1 ATTCAGCAGGTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:19585102/68‑1 ATTCAGCAGATAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:25134791/68‑1 TCAGCAGTTAAAAGCGG‑GGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCA < 1:4476606/68‑1 CAGCCGTTAAACGCGGCGGGGCGCGTATAAATTGCCGCCCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCA < 1:27957650/68‑1 CAGCAGATAAAATCCGCGGGGAGCGTATTAAATGCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATTCTTCA < 1:8525068/68‑1 aAAACGCGGCGGGGCGCTTATAAATTCCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:3318052/67‑1 TAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:5884823/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:124163/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:21863446/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:3641066/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:23618377/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:35345492/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:38342949/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:4729011/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:5871663/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:10623284/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:7011394/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15183970/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15155545/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:17380771/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:25585894/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:26653220/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:27797932/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:35914269/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:24590936/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:1689791/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:32155985/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:16441310/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:34207094/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:34457224/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:24268147/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:18424943/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:30143195/1‑67 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:32844974/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:16166178/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:1921310/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:30797091/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:31785791/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:33593438/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:15967306/1‑66 CCGCTTTTAACTGATGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACTCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:28667703/1‑66 CGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCT < 1:35950218/68‑1 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCCCGCCAATCCAGGTCTG > 1:22222708/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTTTG > 1:27232702/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:18399541/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:26848877/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTC‑ATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGG < 1:7712044/68‑1 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGG > CP009273/108799‑108865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |