New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 519440 = | 420 (0.890) | 22 (0.050) | 9/96 | NT | 5.5% | coding (724/4281 nt) | rhsD | Rhs family putative polymorphic toxin |
? | CP009273 | 519532 = | 398 (0.980) | coding (816/4281 nt) | rhsD | Rhs family putative polymorphic toxin |
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
AGAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/519514‑519440 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccgcccTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCG > CP009273/519532‑519597 AGAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑GGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT < 1:16605085/68‑1 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:25031391/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:25332421/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:36585279/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:37873862/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:18035071/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:12053699/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:30334384/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:5233516/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:27918385/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:38523348/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:38676538/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:14153304/1‑67 GAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACT > 1:15918725/1‑67 AGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCC > 1:32864855/1‑68 AGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCC > 1:34158101/1‑68 AGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCC < 1:24697701/67‑1 ATAGCGACGAGGGGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:28974371/68‑1 ATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCC‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCCCCAGCCGGAACTCCCG > 1:21409912/1‑67 ATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCC‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCG > 1:30369377/1‑67 ATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCACGCGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCC > 1:26993033/1‑68 ATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCG > 1:29482371/1‑67 ATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCG > 1:16404694/1‑67 ATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCG > 1:13862494/1‑67 ATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCG > 1:13446799/1‑67 tcGCGAAGATGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:4107167/65‑1 tcGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:27011674/65‑1 tcGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:11744545/65‑1 TAGCGAAGCGGGGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCGGCGTGGGCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:26670926/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCC < 1:10865895/68‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:35179065/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:35047514/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:24938415/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:23756390/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:25915404/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:31094505/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:27558487/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:30169021/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:29643163/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:28395594/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:2853679/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:29438496/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:37953987/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:8098083/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:6581958/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:12749987/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:465460/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:4652418/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:14578373/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:14994108/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:17088635/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:17346196/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:3860579/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:18281997/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:36694889/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:19115593/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:19293386/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:20018788/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:20676734/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:21203890/67‑1 TAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:22540697/67‑1 TAGCGAACAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:11552854/67‑1 CTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGC < 1:20365983/49‑1 A‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGAC > 1:7655646/1‑67 GCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACAC > 1:221652/1‑67 TGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGG > 1:23327589/1‑68 TGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGG > 1:25725821/1‑68 CGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGT > 1:9296475/1‑67 CGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGT > 1:28007300/1‑67 TCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGCCACACTGCCCGGTACCGAA > 1:32678745/1‑68 TCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAA > 1:10416593/1‑68 GCACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATAC > 1:8733608/1‑68 ACCAGACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACG > 1:36097954/1‑67 ACGGAACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCG > 1:31466660/1‑68 ACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGG > 1:25688807/1‑68 ACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGG > 1:16263850/1‑68 ACTCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGG > 1:37279830/1‑68 TCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGG < 1:6083110/66‑1 TCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGG < 1:12745106/66‑1 TCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGG < 1:17627743/66‑1 TCCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAG < 1:17609773/65‑1 CCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGT < 1:8360125/68‑1 CCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGT > 1:13007810/1‑68 CCCGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGT < 1:17852855/68‑1 CGCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACCCACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTA > 1:36819141/1‑67 GCCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATC < 1:15097283/68‑1 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGCCACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTAGCC > 1:7933943/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACCCTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:34438520/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:18472451/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:10272674/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:19783845/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:11034236/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:12179139/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:6330857/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:18555719/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:1399488/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:38749589/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:37697971/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCC > 1:38177726/1‑68 CCCTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATAAGGCCCCGACAGGGGTATC > 1:18149032/1‑67 AGAAGATAGCGAAGAGGTGCGGGCCTCTTCCGCA‑‑CGCTGCGCCTGCGTGGTCAGCACCAGACGGAACTCCCGCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/519514‑519440 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tcccgcccTCTCTCAGCCTCAGCGTTCCCCGACACACTGCCCGGTACCGAATACGGCCCCGACAGGGGTATCCG > CP009273/519532‑519597 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |