| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2499292 | 408 (0.860) | 22 (0.050) | 11/98 | NT | 5.0% | coding (820/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2499321 | 473 (1.150) | coding (791/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < CP009273/2499321‑2499256 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:36647376/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:18330835/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:14766221/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:30516359/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:33505917/1‑67 TTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCC > 1:14493965/1‑68 TCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCG > 1:12322475/1‑68 CAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGG < 1:4545881/68‑1 CAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGG < 1:27523262/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:4152976/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:5622124/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:36377411/68‑1 ATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC > 1:32870463/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATG > 1:11038560/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATG > 1:2636084/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCGGGCCGCAGGGTGGCGTTG > 1:34862396/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGG > 1:26096664/1‑67 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:2009469/1‑68 TTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCA > 1:10657562/1‑68 TTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGGCTTTACAGAAGCA > 1:38251035/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:14010320/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:33516270/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:3903033/1‑68 TGTAATGACCCGGCGTGCGCTGGCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGTAGCAGGT > 1:3624376/1‑68 TGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGT > 1:21026474/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTGATTACAGAAGCAGGTTAg > 1:20371789/1‑67 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:36565583/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:37286516/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:37329324/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:38230442/1‑68 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGACGCAGGTTATG > 1:19054345/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:33655035/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:18907711/1‑67 GACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGC > 1:20651399/1‑68 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGCCGCTGCCGCGCGCCGGGACATTACAGAAGCTGGTTATGGCG > 1:2611393/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGCCGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:19190814/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGCTGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGGTATGGCG > 1:32837370/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGCTGCCGCGCGCCGGGTCAGTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:6375105/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCTCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:22788812/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCTCGACGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:5997677/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCTGGTTATGGCG > 1:22299442/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:16127266/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:1539398/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:821328/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:11630004/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:30794447/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:12957630/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:19237303/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:28608973/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:14223108/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:5034722/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:23572546/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:17097775/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:23669291/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:23715806/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:16053484/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:20983227/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:14782595/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGGTATGGCG > 1:31253435/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGGTATGGCG > 1:2565396/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTGGCCGATGCCGCGCGCCGGGGCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:11112758/1‑67 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGAC < 1:37188480/68‑1 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:31269122/1‑66 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:30259509/1‑66 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:5459653/1‑66 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:35097370/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:3716203/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:28089418/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:15520444/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:12198085/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:17482523/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:30167165/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:23925413/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:31366783/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:12638561/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:36135535/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA > 1:13969501/1‑68 GCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT > 1:33533224/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACCGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:22131047/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:17223741/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:38631519/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:4949172/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:24006378/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:5537665/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:4165368/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:28882913/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:30800368/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:33986471/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:3244696/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:12962714/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:10696740/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:33444883/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:20366162/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:27115039/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:28316638/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:31277500/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:33371186/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCAGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:33380207/1‑68 GTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:15314604/1‑67 GTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:23927705/1‑67 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < CP009273/2499321‑2499256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |