| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3293574 = | 446 (0.950) | 22 (0.060) | 10/90 | NT | 6.5% | coding (250/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3293608 = | 272 (0.720) | coding (284/303 nt) | yhbQ | GIY‑YIG nuclease superfamily protein | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3293649‑3293574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tctgcaaacccCGGAGATTAAAAGCGATTGAAATGCTCGTGATACTCAACCAGGCCGGTAACGCCATTCAGCGCGTC > CP009273/3293608‑3293673 cgGGTTGAGTATCACGAGCATTTCCATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:27373213/66‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:8427378/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:37341534/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:33458352/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:38312161/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:30615571/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:38972797/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:24793760/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:900567/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCT < 1:11622085/68‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:21787451/67‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:216200/67‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:8236113/67‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:21110538/67‑1CTGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTC < 1:16701468/67‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:38930145/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:22023199/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:21268961/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:5912725/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:364658/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:19372100/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:18712597/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:27566404/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:17620711/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:15782992/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:15636361/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:34926499/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:30317090/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:6883748/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:10669148/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:34289764/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGGTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:633947/68‑1 TGGTTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCATTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:9195914/68‑1 TGGTGGAGTAGCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:37853274/68‑1 TGGGTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTG < 1:20264912/68‑1 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:11264082/1‑68 TTGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:23750859/1‑68 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:22904643/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA < 1:14987853/67‑1 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:25076272/1‑67 TGAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAA > 1:36883238/1‑67 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:24220389/68‑1 GAGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC < 1:3965303/68‑1 AGTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:38131079/1‑67 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:12084530/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACC < 1:20842438/67‑1 GTATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:18493656/1‑66 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAgc > 1:7242051/1‑63 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:29677629/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:14658422/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:32342324/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:1773306/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:26668540/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAAC > 1:37074116/1‑65 TATCACGAGCATTTCAATCGCGTTTAATCTCCGGGGTTTGGAGCCTGCTTAAAAGCTCTGCAAAC > 1:31576559/1‑65 ATCACGAGCATTTCAATCCCTTGTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTCCAAACCCC < 1:13329376/67‑1 ccAGCAATTCAATCGCTTTTCCTCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCAGCAAACCCCGGAGA < 1:35119769/66‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:2498551/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:22514748/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGGGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:30915494/68‑1 CGAGCATTTCAATCGCTTTTAATCTCCGGCGTTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGA < 1:17319088/68‑1 AATCGCTTTTAATCTCCGGGGCTTGCAGACTGCTTAACAGCTCTGCAAACCCCGGAGATTAAAAGCGA < 1:11356981/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |