| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1171846 | 359 (0.760) | 17 (0.040) | 8/96 | NT | 5.6% | coding (964/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein |
| ? | CP009273 | = 1171942 | 264 (0.650) | coding (1060/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein | |||||
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
CCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGA > CP009273/1171779‑1171912 | cTGCAAACGCAAGGCTTCACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:9217118/68‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:26635303/68‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:7488199/68‑1 (MQ=255) tGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCggg < 1:18033557/68‑1 (MQ=255) gCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGa < 1:13130973/68‑1 (MQ=255) gCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGa < 1:16969640/68‑1 (MQ=255) gCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGa < 1:28801218/68‑1 (MQ=255) aaaCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGAtt > 1:3993044/1‑68 (MQ=255) aaCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTa > 1:15030436/1‑68 (MQ=255) cGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATc < 1:25067806/68‑1 (MQ=255) aaGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGt < 1:27062887/68‑1 (MQ=255) aaGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGt < 1:38436792/68‑1 (MQ=255) cTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGc < 1:25419840/66‑1 (MQ=255) cTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGa > 1:18183856/1‑68 (MQ=255) cTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGa > 1:33638564/1‑68 (MQ=255) ttAACTCCGCGCCAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGAt < 1:19066336/68‑1 (MQ=255) ttAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGa < 1:15368397/67‑1 (MQ=255) ttAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGAt < 1:6873299/68‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc < 1:20471292/68‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc < 1:8805631/68‑1 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:26132566/1‑67 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:24217160/1‑67 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:19783360/1‑67 (MQ=255) cTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTc < 1:31732742/68‑1 (MQ=255) cTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTc > 1:32018590/1‑68 (MQ=255) cTCCGCCACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGAAAGGGGCCACAGACTGTATTATCGTTTCGCTCCt > 1:9129220/1‑67 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:2126114/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:8316053/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:23218510/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:5532200/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:14184049/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:13463620/1‑68 (MQ=255) aCAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcg > 1:20082659/1‑67 (MQ=255) cAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcggc < 1:33040694/68‑1 (MQ=255) cAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcgg < 1:7898128/67‑1 (MQ=255) tCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCtt < 1:35498631/68‑1 (MQ=255) cATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATc < 1:21815098/52‑1 (MQ=255) atgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagatt > 1:37357667‑M1/1‑31 (MQ=255) atgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgcg > 1:3271765/1‑67 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt > 1:29815753/1‑67 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:5751805/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:23443878/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:17079623/67‑1 (MQ=255) ttATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCtt < 1:2219044/68‑1 (MQ=255) ttATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCtt < 1:37471750/68‑1 (MQ=255) ttATGGAGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCtt < 1:6532057/68‑1 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgccttctagcaggccgccgagtttcgggatcagattatttaactg > 1:30638304‑M1/1‑22 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:36117408/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:32229165/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:14594986/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:38391544/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:21451775/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGATTg > 1:34511751/1‑67 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:34275546/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:20668342/1‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgcgatcaagcaggacgccgattatcggcgtcagagtatttaactg > 1:11728494‑M1/1‑20 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:18654993/1‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:29148544/1‑68 (MQ=255) gTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGTTTTTCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:28999447/1‑67 (MQ=255) 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aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:10013806/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:11319047/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:4560478/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:38157908/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:14103588/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:12159449/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:31372708/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt > 1:28584600/1‑68 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:27522762/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:27251091/68‑1 (MQ=255) 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gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagggcgcc > 1:38837430‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagggcgcc > 1:30182274‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagggcgcc > 1:14800231‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagggcgcc > 1:13767326‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagggcgcc > 1:10372765‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggcgggcaagcagggcgc < 1:30948289‑M1/67‑64 (MQ=255) gcCGTGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGATTGGCGCCCTGCTTTCCAGCCAGTTAaataat < 1:3784368/66‑1 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataat < 1:2555834/66‑1 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa < 1:28059229/65‑1 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATc < 1:15629550/67‑1 (MQ=255) gcCGGGAGTAGCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataat < 1:246808/66‑1 (MQ=255) | CCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGA > CP009273/1171779‑1171912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |