| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1171846 | 359 (0.760) | 17 (0.040) | 8/96 | NT | 5.6% | coding (964/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein |
| ? | CP009273 | = 1171942 | 264 (0.650) | coding (1060/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein | |||||
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
TGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGC > CP009273/1171878‑1172009 | ggCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggc > 1:38262937‑M2/1‑64 (MQ=255) ggCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggc > 1:30182274‑M2/1‑64 (MQ=255) ggCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggc > 1:11697887‑M2/1‑64 (MQ=255) cgcCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcg > 1:33027323‑M2/1‑62 (MQ=255) cgcCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcg > 1:1187776‑M2/1‑62 (MQ=255) gcCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgct > 1:22580255‑M2/1‑61 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccc > 1:25004184‑M2/1‑56 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccc > 1:37816109‑M2/1‑56 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccc > 1:11088887‑M2/1‑56 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCgg < 1:8270169/68‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGt > 1:10024625/1‑68 (MQ=255) tGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggcccctt > 1:1380028‑M2/1‑53 (MQ=255) tGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTgg < 1:28774078/68‑1 (MQ=255) tGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTg > 1:28405096/1‑67 (MQ=255) ccagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCt > 1:15731369/1‑68 (MQ=255) agccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTa > 1:27950226/1‑67 (MQ=255) cagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGGCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccccttgcacca > 1:36574819‑M2/1‑46 (MQ=255) cagTAAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccccttgcac > 1:19988987‑M2/1‑46 (MQ=255) taaataaaCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:5620245/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:36726358/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:18269495/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:17757287/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:17477276/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:24773893/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:27776435/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:29039541/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:12785419/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:8736390/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:3105728/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:33869692/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:454456/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:9740352/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:23186746/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:25500615/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:11398426/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:25666033/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:37364734/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:1248484/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:32231925/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:18549924/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:29642529/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:18104975/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGAGGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:36282499/68‑1 (MQ=255) aatCTGATGGCGATAATCCGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:7495063/1‑68 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:31649844/1‑68 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:7843360/1‑68 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:14174593/1‑68 (MQ=255) atCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAg < 1:38676654/68‑1 (MQ=255) atCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAg < 1:15143513/68‑1 (MQ=255) tCTTATGCCGATAATCGGCGTGTTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGTTGGCTATCGAACCTTTACatg < 1:20184424/68‑3 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:25141265/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:13501731/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:29232393/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg > 1:14642868/1‑68 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:6526177/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg > 1:19007414/1‑68 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:35158425/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg > 1:34331264/1‑68 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg > 1:10808897/1‑67 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGt < 1:29512994/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:4008479/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:32523385/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:36977279/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:26818750/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:11519743/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:14948277/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:23486816/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:13181723/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:21265807/68‑1 (MQ=255) gCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTg > 1:10700827/1‑68 (MQ=255) gCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTg > 1:21569988/1‑68 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:37912184/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:30459364/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:33176960/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:12643090/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGt < 1:31123376/67‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGt < 1:5795262/67‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGt < 1:34135018/67‑1 (MQ=255) ggCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccccttgcaccataaagaccatcatgatttgtcgcggagt > 1:9098560‑M2/1‑19 (MQ=255) ggCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCt < 1:21422664/68‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtggt < 1:22268662/68‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:7317000/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:31855098/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:16012417/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:16775553/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:20317593/67‑1 (MQ=255) ccTGCTTGATTGCGCGGCGCTGCCGGGGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtggtgg < 1:5905555/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtggtgg < 1:17037285/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtggtg > 1:20353699/1‑67 (MQ=255) cTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGc < 1:15413636/68‑1 (MQ=255) cTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGc < 1:22814555/68‑1 (MQ=255) cTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGc > 1:27415523/1‑68 (MQ=255) gCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGa < 1:26289706/68‑1 (MQ=255) ttGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATg < 1:7039875/68‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCt < 1:35988823/67‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCt < 1:24062522/67‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTa > 1:1033251/1‑67 (MQ=255) gcggcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATcgc < 1:16350184/68‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATcgc < 1:5361834/68‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATcgc < 1:3473899/68‑1 (MQ=255) | TGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGC > CP009273/1171878‑1172009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |