| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2707629 = | NA (NA) | 9 (0.020) +TTC |
3/106 | NT | NA | intergenic (+40/+169) | srmB/yfiE | ATP‑dependent RNA helicase/putative DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | CP009273 | = 3323920 | NA (NA) | intergenic (+165/+21) | dacB/obgE | D‑alanyl‑D‑alanine carboxypeptidase/GTPase involved in cell partioning and DNA repair | |||||
Only 100 of 729 total aligned reads displayed.
CGTGCCACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTT > CP009273/2707562‑2707695 | cGTGCCACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGc > 1:8107300/1‑68 (MQ=255) cACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCATGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAAc < 1:12800090/67‑1 (MQ=255) cACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAAc > 1:169264/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAAc > 1:15607261/1‑67 (MQ=255) cACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAAc > 1:12275983/1‑67 (MQ=255) aCCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCAAGGTTAAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGc > 1:1158497/1‑68 (MQ=255) aCGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACt > 1:37708494/1‑67 (MQ=255) cGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGc < 1:34330206/68‑1 (MQ=255) cGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGc < 1:35970373/68‑1 (MQ=255) cGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGc < 1:18558202/68‑1 (MQ=255) cAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTg > 1:22908276/1‑68 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:7695104/1‑68 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:10870213/1‑68 (MQ=255) agagTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:30238480/1‑68 (MQ=255) agTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATgc > 1:16199731/1‑66 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc > 1:33982367/1‑68 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc > 1:3325467/1‑68 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:3187037/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:14657982/68‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTAc < 1:24142653/68‑1 (MQ=255) aTCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGTTATTAAAAGTGCTGGCAAACGGAAAACTGCCTGATGCGCTACg < 1:2113099/68‑1 (MQ=37) ctcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCt > 1:37391983/1‑68 (MQ=255) ctcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCt > 1:4500514/1‑68 (MQ=255) ctcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCt > 1:9262226/1‑68 (MQ=255) ctcAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCt < 1:11247917/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:5450306/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:27320449/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:12098915/68‑1 (MQ=255) cAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTa < 1:20450817/68‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg > 1:37913948/1‑68 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg > 1:1450001/1‑68 (MQ=255) gCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAg < 1:10312101/68‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTGAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:27745805/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:35500873/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:9486484/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:10011721/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg < 1:15473786/67‑1 (MQ=255) cAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGc < 1:25718150/68‑1 (MQ=255) aGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAgg > 1:38628682/1‑66 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCt < 1:17953517/66‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa < 1:25847178/67‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa < 1:33679269/67‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa < 1:29822015/67‑1 (MQ=255) tttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa < 1:16591371/67‑1 (MQ=255) ttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAc < 1:15078814/67‑1 (MQ=255) ttAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACg > 1:20193671/1‑68 (MQ=255) aaGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg < 1:6696956/68‑1 (MQ=255) aGCCTGGTATTTAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTAGGTgg < 1:34654488/68‑1 (MQ=255) gtagcgcatcaggctgatgaaCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGtga < 1:35083326‑M1/46‑2 (MQ=255) gtagcgcatcaggctgatgaaCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGtga < 1:18910523‑M1/46‑2 (MQ=255) gtagcgcatcaggctgatgaaCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGtga < 1:31097432‑M1/46‑2 (MQ=255) gCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 1:28800976/1‑66 (MQ=255) gCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 1:29110036/1‑66 (MQ=255) gCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 1:7050455/1‑66 (MQ=255) gCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTg > 1:32297994/1‑66 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTgg > 1:30588674/1‑66 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc > 1:32506341/1‑67 (MQ=255) ccTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc > 1:17214780/1‑67 (MQ=255) cTGGTATTTAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCt < 1:21411080/67‑1 (MQ=255) cTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc < 1:26754536/66‑1 (MQ=255) cTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGc < 1:26027265/66‑1 (MQ=255) ggTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCAt < 1:37152229/68‑1 (MQ=255) ggTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCAt < 1:36453833/68‑1 (MQ=255) ggTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCAt < 1:26558691/68‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCTAACGCATAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGc < 1:38333909/67‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGc < 1:26311637/67‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGc < 1:23618597/67‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCa < 1:13973637/68‑1 (MQ=255) aTTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCa > 1:28094382/1‑68 (MQ=255) ttAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCaa < 1:4139575/68‑1 (MQ=255) ttAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCaa < 1:4783241/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:5136198/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:14317061/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:22014351/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:8592281/68‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAata < 1:25356029/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGGAatat > 1:7250602/1‑68 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:6533393/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:19362257/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat > 1:19871253/1‑68 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:32859187/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:31728049/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat > 1:7916125/1‑68 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:29359426/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatat < 1:23393845/68‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCGACGTGGCTCATGCAatat < 1:8957942/68‑1 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:1307672/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:34203618/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:30863435/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:28335657/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:27070374/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:26914053/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatata > 1:24560826/1‑68 (MQ=255) aaGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGAAatata > 1:20949617/1‑68 (MQ=255) aGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAatatat > 1:14783450/1‑68 (MQ=255) gTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCTATATAtt > 1:21759253/1‑68 (MQ=255) gCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGa < 1:38902861/68‑1 (MQ=255) tGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGaa < 1:6158005/67‑1 (MQ=255) tGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGaa < 1:34825530/67‑1 (MQ=255) tGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGaa < 1:2263475/67‑1 (MQ=255) | CGTGCCACCGCAAACGACAGAAGAGTAATCTCAATGCCAGGTTTAAGCCTGGTATTAAAAGTGCTGGCAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGTGGCTCATGCAATATATTGAATTT > CP009273/2707562‑2707695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |