| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3113142 = | 363 (0.770) | 14 (0.030) | 7/98 | NT | 5.0% | coding (1497/1683 nt) | glcA | glycolate transporter |
| ? | CP009273 | 3113164 = | 212 (0.510) | coding (1475/1683 nt) | glcA | glycolate transporter | |||||
Only 100 of 492 total aligned reads displayed.
CCATGCCCGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGT > CP009273/3113075‑3113208 | ctctaacgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctgc > 1:23838537‑M1/67‑68 (MQ=255) taacgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgccaccctGCTgg < 1:10310059‑M1/5‑1 (MQ=255) taacgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTgg < 1:17528448‑M1/5‑1 (MQ=255) taacgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTgg < 1:14291620‑M1/5‑1 (MQ=255) taacgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggagcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTgg < 1:18167352‑M1/5‑1 (MQ=255) cccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgt > 1:34579475/1‑68 (MQ=255) cccGTCGCGGCGCACGCCACGGCCATAGATTGCCGGGAGATCAACTTGCCACTTACGCCGCCGCt > 1:25508122/1‑65 (MQ=255) ccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgtg > 1:7469189/1‑68 (MQ=255) ccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgtg > 1:22686927/1‑68 (MQ=255) ccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgtg > 1:29687060/1‑68 (MQ=255) ccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgtg > 1:33806639/1‑68 (MQ=255) ccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgtg > 1:30004431/1‑68 (MQ=255) ccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgtg > 1:31337969/1‑68 (MQ=255) ccGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGgt < 1:36147332/67‑1 (MQ=255) acgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:6148710‑M1/7‑1 (MQ=255) acgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:3277650‑M1/7‑1 (MQ=255) acgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:4382053‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:18518226‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:20892289‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:18488362‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:28518362‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:16867926‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:16313851‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:34022909‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:4733723‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:12761559‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgtttggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:38214372‑M1/7‑1 (MQ=255) cgccctgattggttcactgcaatcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGgtg < 1:9411443‑M1/7‑1 (MQ=255) cgcgGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGttt < 1:19035477/67‑1 (MQ=255) gcggcgCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGCTCATCTTGCCAGTTACGACGCAGCTGGTGttt > 1:8762397/1‑66 (MQ=38) gcggcgCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGttt > 1:2525597/1‑66 (MQ=255) cgcAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTtgctgc < 1:37770645/67‑1 (MQ=255) gcAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGATATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGcca < 1:26928046/68‑1 (MQ=255) gcAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGcca < 1:4058513/68‑1 (MQ=255) gcAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGcca < 1:33516163/68‑1 (MQ=255) gcAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGcca < 1:24183340/68‑1 (MQ=255) gcAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGcca < 1:17375040/68‑1 (MQ=255) ccACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGccacca < 1:30442527/66‑1 (MQ=255) ccACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGccacc < 1:37971225/65‑1 (MQ=255) ccACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGccacc < 1:28796904/65‑1 (MQ=255) ccACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACcagc > 1:36764632/1‑68 (MQ=255) ccACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACcagc > 1:20095714/1‑68 (MQ=255) ccACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACcag < 1:12475921/67‑1 (MQ=255) ccACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACcag < 1:703836/67‑1 (MQ=255) cGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAgg < 1:3194359/68‑1 (MQ=255) cGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAgg < 1:30697247/68‑1 (MQ=255) gCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt > 1:10778090/1‑68 (MQ=255) gCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt > 1:6940626/1‑68 (MQ=255) gCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt > 1:28014165/1‑68 (MQ=255) cGATAGCTTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:37060350/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:19442492/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:15095294/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:16466021/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:23048460/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:26642911/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:21632076/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGAGCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:357290/67‑1 (MQ=255) gATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgtgt < 1:15977793/68‑1 (MQ=255) gATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgtgt < 1:6555067/68‑1 (MQ=255) atcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCGGGTGTTTGCTGCCACCCGCAGGgtgt < 1:19852802‑M1/29‑1 (MQ=255) aGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCa > 1:13301521/1‑67 (MQ=255) accacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGGTGTTTGCTGCCACCCGCCGGGTGGCaga < 1:13932207‑M1/33‑1 (MQ=255) aTTGCGGGGAGATCATGTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGCGTCagag > 1:27739522/1‑68 (MQ=255) aTTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCagag > 1:2732944/1‑68 (MQ=255) aTTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCagag > 1:11845826/1‑68 (MQ=255) ttGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCagag < 1:7872312/67‑1 (MQ=255) ttGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAgaga < 1:38459440/68‑1 (MQ=255) acggcgcagcaaatcaacgtctctggcaccctGCGGGTGTTTGCTGGCACCAGCAGGGTGTCAGAGAc < 1:816727‑M1/36‑1 (MQ=255) gCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACg < 1:37417249/68‑1 (MQ=255) ggggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGtt > 1:18031725/1‑68 (MQ=255) ggggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGtt < 1:860307/68‑1 (MQ=255) ggggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGtt < 1:31073491/68‑1 (MQ=255) ggggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGt < 1:15650817/67‑1 (MQ=255) gggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTg > 1:11067991/1‑68 (MQ=255) ggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGa > 1:35527673/1‑68 (MQ=255) ggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGa > 1:7758769/1‑68 (MQ=255) ggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGa > 1:32318440/1‑68 (MQ=255) gagaTCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGa < 1:5646718/67‑1 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctgc > 1:2193815/1‑68 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctgc > 1:29061226/1‑68 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctgc > 1:29306303/1‑68 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctgc > 1:11514957/1‑68 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctgc > 1:33101477/1‑68 (MQ=255) ttGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTgcg > 1:2564533/1‑67 (MQ=255) tGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGcc < 1:10006615/68‑1 (MQ=255) ccAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt > 1:9535353/1‑68 (MQ=255) cAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt < 1:13480864/67‑1 (MQ=255) aGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTgg > 1:34961636/1‑68 (MQ=255) tACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTgg < 1:24581824/65‑1 (MQ=255) tACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGt < 1:38839351/66‑1 (MQ=255) tACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGt < 1:14821691/66‑1 (MQ=255) tACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCg < 1:12160969/68‑1 (MQ=255) tACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGACAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCg < 1:36604759/68‑1 (MQ=255) cgccgccgcTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTACTGCGCCGTGGTCGAt < 1:5153072/68‑1 (MQ=255) accctGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGAtt < 1:32983749‑M1/62‑1 (MQ=255) accctGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGAtt < 1:11258136‑M1/62‑1 (MQ=255) cgccgcTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGc < 1:22214235/68‑1 (MQ=255) cgccgcTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGc < 1:25988655/68‑1 (MQ=255) gccgcTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGCTCGATTGCa > 1:34816562/1‑68 (MQ=255) cgcTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGt > 1:5843446/1‑68 (MQ=255) | CCATGCCCGTCGCGGCGCAGGCCACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGT > CP009273/3113075‑3113208 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |