| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3113142 = | 363 (0.770) | 14 (0.030) | 7/98 | NT | 5.0% | coding (1497/1683 nt) | glcA | glycolate transporter |
| ? | CP009273 | 3113164 = | 212 (0.510) | coding (1475/1683 nt) | glcA | glycolate transporter | |||||
Only 100 of 536 total aligned reads displayed.
ACGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTAGAGGA > CP009273/3113098‑3113231 | aCGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACcagcag > 1:8974454/1‑68 (MQ=255) cGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGTTGCCACCAGCAgg < 1:30920824/68‑1 (MQ=255) cGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAgg < 1:25568086/68‑1 (MQ=255) cGGCGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAgg < 1:3194359/68‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:2950051/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:26642911/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:34995899/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:23917172/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:22513293/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:33043138/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:37417170/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:38785621/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:19641019/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:29259737/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:16443413/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:12056212/67‑1 (MQ=255) cGATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgt < 1:15095294/67‑1 (MQ=255) gATAGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGgtgt < 1:21752946/68‑1 (MQ=255) atcgaccacggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGGGGGTGTTTGCTGCCCCCCGCAGGgtg < 1:24359305‑M1/28‑1 (MQ=255) aGATTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCag > 1:35528823/1‑68 (MQ=255) aTTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCagag > 1:10685470/1‑68 (MQ=255) aTTGCGGGGAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCagag > 1:27352352/1‑68 (MQ=255) acggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctcctggtggcagcaaacaccagcAGGGTGTCAGAGAc < 1:7277057‑M2/14‑1 (MQ=255) acggcgcagcaaatcaacgtctctgacaccctGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGAc < 1:27076159‑M1/36‑1 (MQ=255) ggggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGtt > 1:23294709/1‑68 (MQ=255) gggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTg > 1:9542372/1‑68 (MQ=255) gggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTg > 1:11067991/1‑68 (MQ=255) ggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCTGGGTGTCAGAGACGTTGa > 1:429699/1‑68 (MQ=255) ggAGATCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGa > 1:7758769/1‑68 (MQ=255) gagaTCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGa < 1:12628827/67‑1 (MQ=255) gagaTCATCTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGAt > 1:3701218/1‑68 (MQ=255) tcatcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGAttt < 1:8379443/66‑1 (MQ=255) tcatcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGAttt < 1:796994/66‑1 (MQ=255) aaatcaacgtctctgacaccctGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGAttt < 1:33754825‑M1/44‑1 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctgc > 1:29061226/1‑68 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctgc < 1:6910073/68‑1 (MQ=255) tcTTGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTtgctg > 1:138858/1‑67 (MQ=255) tGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGcc < 1:10006615/68‑1 (MQ=255) tGCCAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGcc < 1:30640112/68‑1 (MQ=255) gtctctgacaccctGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt < 1:30280388‑M1/54‑1 (MQ=255) ccAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt > 1:17233553/1‑68 (MQ=255) ccAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt > 1:15701257/1‑68 (MQ=255) cAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt < 1:24486261/67‑1 (MQ=255) cAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt < 1:11343356/67‑1 (MQ=255) cAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt < 1:11655590/67‑1 (MQ=255) cAGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGt < 1:32942677/67‑1 (MQ=255) aGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTgg > 1:38012092/1‑68 (MQ=255) aGTTACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTgg > 1:1557573/1‑68 (MQ=255) tACGCCGCCGCTGGTGTTTGCTGCCACCAGCAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGt < 1:14821691/66‑1 (MQ=255) 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caccagcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCg < 1:1765565‑M2/60‑1 (MQ=255) caccagcAGGGTGTCAGAGACGTTGAATTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCg < 1:36717688‑M2/60‑1 (MQ=255) ccagcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTa < 1:4039601‑M2/63‑1 (MQ=255) ccagcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTa < 1:22824934‑M2/63‑1 (MQ=255) ccagcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTa < 1:18199128‑M2/63‑1 (MQ=255) ccagcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTa < 1:5426256‑M2/63‑1 (MQ=255) ccagcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTa < 1:33967328‑M2/63‑1 (MQ=255) ccagcAGGGTGGCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTa < 1:34722940‑M2/63‑1 (MQ=255) gcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCTCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTagag > 1:1218722‑M2/3‑68 (MQ=255) gcAGGGTGTCAGAGACGTTGATTTGCTGCGCCGTGGTCGATTGCAGTGAACCAAACAGGGCGTTagag > 1:6971834‑M2/3‑68 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |