| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3333655 | 319 (0.680) | 18 (0.050) | 11/94 | NT | 5.5% | coding (22/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
| ? | CP009273 | = 3333682 | 353 (0.890) | coding (49/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter | |||||
Only 100 of 657 total aligned reads displayed.
AAAATCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTT > CP009273/3333588‑3333721 | aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGtt < 1:23753969/68‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:28645493‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:18752494‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:1466841‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:37271245‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:24858350‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:23379291‑M1/67‑1 (MQ=255) aaaTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGT < 1:21098454‑M1/67‑1 (MQ=255) aTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTaa < 1:1666008/68‑1 (MQ=255) aTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTaa > 1:38225599/1‑68 (MQ=255) aTCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTaa < 1:36100205/68‑1 (MQ=255) tCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAAt > 1:12910600/1‑68 (MQ=255) ttCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAAttg > 1:19540905/1‑68 (MQ=255) gCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTgg > 1:18954235/1‑68 (MQ=255) gCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTgg > 1:920161/1‑68 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTgg < 1:22566468/66‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:21334652/67‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:95714/67‑1 (MQ=255) ggACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGt < 1:10855526/67‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTAc < 1:18203753/68‑1 (MQ=255) ccGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTAc < 1:4041001/68‑1 (MQ=255) cGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACtttt > 1:29970715/1‑68 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:31028141/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:3315779/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:14339688/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGt < 1:2019766/66‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCg < 1:31540819/68‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCg < 1:5210354/68‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCg < 1:20501085/68‑1 (MQ=255) ataCCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCg < 1:20947166/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGGACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaatta > 1:34250439‑M1/1‑41 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:22924369/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:6051215/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:17801745/1‑68 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac < 1:9370271‑M2/68‑3 (MQ=255) aagaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacag < 1:29076727‑M2/68‑5 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagt > 1:17501738‑M1/1‑36 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:6456459‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt > 1:15393842‑M2/1‑63 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGATTACTTTTGGTCGTTTacagt > 1:36585428‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:30390587‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:16128476‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:27276415‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:27089619‑M2/67‑7 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgt > 1:15687779‑M1/1‑31 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:21621864‑M2/67‑10 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:27978422‑M2/67‑10 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:30714552‑M2/67‑10 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGAcc > 1:11791027/1‑67 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:13154452/1‑68 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:11565411/1‑68 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:18546270/1‑68 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagc > 1:14196802‑M1/1‑21 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtt > 1:8459858/1‑68 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtt > 1:38972236/1‑68 (MQ=255) gCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagca > 1:1217647‑M2/1‑47 (MQ=255) cTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtttt > 1:7486325/1‑68 (MQ=255) ttttAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagcat > 1:24247373‑M2/1‑45 (MQ=255) aGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGcc > 1:12644814/1‑67 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:21266861/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:7060360/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCCCATGGTTTTTGAcgc > 1:38043996/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacg > 1:30270560‑M1/1‑12 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGCCCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:25215812/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:35297734/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:10714067/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:24358633/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:23909816/1‑68 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:4410633/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:36505094/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:3357408/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:32092527/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:29552181/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:24532762/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:1509530/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:10019820/67‑1 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:28295254‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:27471431‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:26370890‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:26210930‑M1/67‑59 (MQ=255) cGGCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcc < 1:19855993‑M1/67‑59 (MQ=255) ggCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTa > 1:6204554/1‑68 (MQ=255) ggCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTa > 1:795962/1‑68 (MQ=255) gCACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctt > 1:37758660‑M1/1‑7 (MQ=255) gCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:13830419/1‑68 (MQ=255) cACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtccttt < 1:10127418‑M1/67‑62 (MQ=255) cACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtccttt < 1:35531622‑M1/67‑62 (MQ=255) cACTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtccttt < 1:35006042‑M1/67‑62 (MQ=255) cACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt < 1:26897716/67‑1 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaatccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcagctaacgtcctttct > 1:7982771‑M1/1‑5 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct < 1:4784894‑M1/68‑64 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct < 1:25683592‑M1/68‑64 (MQ=255) aCTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct < 1:11154502‑M1/68‑64 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:16518860/1‑66 (MQ=255) cTGTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttct > 1:26581481‑M1/1‑4 (MQ=255) tGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:33910482/59‑1 (MQ=255) gTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca < 1:38756516‑M1/68‑67 (MQ=255) gTaaacgaccaaaagtaaaccaacaattaacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca < 1:8239687‑M1/68‑67 (MQ=255) gTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCttt > 1:32636507/1‑68 (MQ=255) gTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGGCGTTTacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtcctttcttca > 1:17160194‑M2/1‑29 (MQ=255) | AAAATCTTCAGCGGACCGGCGAGTATACCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTT > CP009273/3333588‑3333721 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |