New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3333655 | 319 (0.680) | 18 (0.050) | 11/94 | NT | 5.5% | coding (22/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
? | CP009273 | = 3333682 | 353 (0.890) | coding (49/978 nt) | yrbG | putative calcium/sodium:proton antiporter |
Only 100 of 537 total aligned reads displayed.
CCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCTGAT > CP009273/3333615‑3333749 | cccgaagaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:11144581/4‑68 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:9376569/1‑68 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:18850840/68‑1 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt > 1:37492135/1‑68 (MQ=255) ccTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGttt < 1:6051215/68‑1 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTATCTACGGCTCTGTTAATTGTTGGTTTTCTTTTGGTCGTTTac > 1:16168959‑M2/1‑66 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac < 1:26335773‑M2/68‑3 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac < 1:28637137‑M2/68‑3 (MQ=255) tGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTac < 1:8270597‑M2/68‑3 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGCTGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGATTACTTTTGGTCGTTTacagt > 1:7982771‑M2/1‑63 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:34039806‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt > 1:18727693‑M2/1‑63 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:2361134‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagt < 1:27202902‑M2/68‑6 (MQ=255) agaaAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGATTACTTTTGGTCGTTTacagt > 1:36585428‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:35531622‑M2/67‑7 (MQ=255) aaaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg < 1:30390587‑M2/67‑7 (MQ=255) aaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgcc < 1:17742404‑M2/68‑9 (MQ=255) aaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgc > 1:37758660‑M2/1‑60 (MQ=255) aaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgc > 1:31941175‑M2/1‑60 (MQ=255) aaGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtg > 1:17043615‑M2/1‑60 (MQ=255) ggACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccg < 1:12511607‑M2/67‑10 (MQ=255) aCGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGAcc > 1:8614529/1‑68 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtag > 1:24715522‑M2/1‑55 (MQ=255) cGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGAcc > 1:29717009/1‑67 (MQ=255) gTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGc < 1:27044357/68‑1 (MQ=255) gTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGc < 1:30055045/68‑1 (MQ=255) tAGATGCTTTTTGCTACGGCACTGTTAATTGTTTGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGcc < 1:14394664/67‑1 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:3301116/1‑68 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:12713704/1‑68 (MQ=255) aGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTg > 1:18546270/1‑68 (MQ=255) aTGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGt > 1:30800604/1‑68 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTgg < 1:17242820/66‑1 (MQ=255) tGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGtt > 1:38972236/1‑68 (MQ=255) gCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagca > 1:14196802‑M2/1‑47 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:21266861/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:7060360/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:38882363/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:5198448/1‑68 (MQ=255) gCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgc > 1:14708286/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:21002703/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:26833937/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:24358633/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:38262838/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:18234999/1‑68 (MQ=255) cTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:19953790/1‑68 (MQ=255) tACGGCCCTGTTAATTGGTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:10285729/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:9647468/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:10019820/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:7392109/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:13836778/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:4277211/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:15471095/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:3357408/67‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGt < 1:33834234/68‑1 (MQ=255) tACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGt < 1:21420686/68‑1 (MQ=255) tACGGCACTGGTAATTGTTGGTATACTTTTGGTCGGTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg < 1:27823555/67‑1 (MQ=255) aCGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:16689597/1‑66 (MQ=255) aCGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCcgcg > 1:20617476/1‑66 (MQ=255) ggCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTa > 1:6204554/1‑68 (MQ=255) gCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:26452415/1‑68 (MQ=255) gCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:28306145/1‑68 (MQ=255) cACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTacagtgccgtagctaaaagcatctaacgtccttt > 1:35093200‑M2/1‑33 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:27331014/1‑66 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:11675318/1‑66 (MQ=255) aCTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTAt > 1:7810190/1‑66 (MQ=255) tGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCtt > 1:7662937/1‑68 (MQ=255) gTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCttt > 1:32636507/1‑68 (MQ=255) tAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTg > 1:29376512/1‑67 (MQ=255) tAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTATg > 1:10745211/1‑67 (MQ=255) ttgttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGa > 1:31056828/1‑68 (MQ=255) ttgttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGa > 1:34259752/1‑68 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTTGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAAc < 1:22741868/68‑1 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:11935647/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:25145108/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:14875782/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:2531339/1‑67 (MQ=255) gttgGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGaa > 1:24138407/1‑67 (MQ=255) 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ttttGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCAt > 1:17970538/1‑67 (MQ=255) tttGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATc > 1:21874989/1‑67 (MQ=255) tttGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACATTTGGCATc > 1:15266559/1‑67 (MQ=255) gTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc > 1:36068434/1‑68 (MQ=255) tCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc < 1:2209559/67‑1 (MQ=255) tCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc < 1:24464176/67‑1 (MQ=255) tCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCccgcc < 1:36368238/67‑1 (MQ=255) cGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCcgccgc < 1:5778146/68‑1 (MQ=255) cGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCcgccgc < 1:36972568/68‑1 (MQ=255) gTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCt < 1:15724935/68‑1 (MQ=255) gTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCt < 1:16500292/68‑1 (MQ=255) ttACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCTGa < 1:35289689/68‑1 (MQ=255) | CCTGAAGAAAGGACGTTAGATGCTTTTAGCTACGGCACTGTTAATTGTTGGTTTACTTTTGGTCGTTTACAGTGCCGACCGCCTGGTTTTTGCCGCGTCTATTCTTTGCCGAACCTTTGGCATCCCGCCGCTGAT > CP009273/3333615‑3333749 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |