| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2161385 | 567 (1.200) | 29 (0.080) | 10/90 | NT | 5.9% | intergenic (‑90/+85) | yegZ/yegR | pseudogene, gpD phage P2‑like protein D/uncharacterized protein |
| ? | CP009273 | = 2161396 | 475 (1.250) | intergenic (‑101/+74) | yegZ/yegR | pseudogene, gpD phage P2‑like protein D/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 687 total aligned reads displayed.
CTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAGCCAGAACGCGCATATTTGACGCTTACCAAAAA > CP009273/2161329‑2161463 | ctGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATc > 1:23271675/1‑68 (MQ=255) gTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggc < 1:10101294‑M2/68‑4 (MQ=255) gTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggc < 1:19637111‑M2/68‑4 (MQ=255) tAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCAGGATGCCTTTCACTTATCggc > 1:15758246‑M2/1‑64 (MQ=255) tAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggca < 1:22875497‑M2/68‑5 (MQ=255) aCCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatc < 1:25448630‑M2/68‑7 (MQ=255) ccGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcg < 1:15378751‑M2/68‑8 (MQ=255) cgacTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGt < 1:10382467/65‑1 (MQ=255) cGTCTTCCATTGACCAGATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgt > 1:39123634‑M2/1‑60 (MQ=255) cGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgt > 1:19470081‑M2/1‑60 (MQ=255) cGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgt > 1:24785879‑M2/1‑60 (MQ=255) cGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgt < 1:15194366‑M2/68‑9 (MQ=255) cGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgt > 1:7182179‑M2/1‑60 (MQ=255) gTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgtg > 1:24203462‑M2/1‑59 (MQ=255) cTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgtgct > 1:3688179‑M2/1‑57 (MQ=255) ttCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTc < 1:33338482/68‑1 (MQ=255) ttCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTc < 1:27176621/68‑1 (MQ=255) tCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgtgctat > 1:16808572‑M2/1‑55 (MQ=255) aTTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATTCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCcac > 1:22523893/1‑68 (MQ=255) aTTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCcac > 1:17171686/1‑68 (MQ=255) aTTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCcac > 1:294813/1‑68 (MQ=255) aTTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCcac > 1:18008757/1‑68 (MQ=255) gACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAgg < 1:4645367/68‑1 (MQ=255) gACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAgg < 1:36468273/68‑1 (MQ=255) aCCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGt > 1:36735543/1‑68 (MQ=255) aCCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGt > 1:28373399/1‑68 (MQ=255) aCCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGt > 1:6577253/1‑68 (MQ=255) ccACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGt > 1:35366659/1‑67 (MQ=255) ccACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGt > 1:4475545/1‑67 (MQ=255) acaTCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgtgctatgaaggaggat > 1:35589803‑M2/1‑45 (MQ=255) caTCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCg < 1:32647496/68‑1 (MQ=255) aTCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCgg < 1:35983953/68‑1 (MQ=255) tCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCggt < 1:8899964/68‑2 (MQ=255) tCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCg > 1:32015096/1‑66 (MQ=255) tCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCg > 1:23771226/1‑66 (MQ=255) tAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACg < 1:2040653/68‑1 (MQ=255) aGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGc > 1:38219841/1‑68 (MQ=255) aGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGc > 1:13214083/1‑68 (MQ=255) aGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGc > 1:20183654/1‑68 (MQ=255) aGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGc > 1:35130132/1‑68 (MQ=255) aGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGc > 1:1486484/1‑68 (MQ=255) aaTCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcac > 1:24563826/1‑68 (MQ=255) aTCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcaca > 1:28837118/1‑68 (MQ=255) aTCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcaca < 1:5341519/68‑1 (MQ=255) aTCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcaca < 1:14517712/68‑1 (MQ=255) aTCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcaca < 1:6896931/68‑1 (MQ=255) aTCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGATTCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcaca > 1:14213940/1‑68 (MQ=255) aTCCTCCTTCATAGCACGATGCCTGTCCCTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcacc > 1:38923332/1‑67 (MQ=255) tcctccTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGcaca > 1:34059846/1‑67 (MQ=255) tcctccTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAg < 1:11688017/68‑1 (MQ=255) cctcctTCATCGCACGATTCCTTTCACTTATCggcatcgtgctatgaaggaggattctatcgatgtgg > 1:792418‑M2/1‑32 (MQ=255) cctcctTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCggcatcgtgctatgaaggaggattctatcgatgtgg > 1:25830972‑M2/1‑32 (MQ=255) cctcctTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAg > 1:1923769/1‑67 (MQ=255) cctcctTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAg > 1:17813294/1‑67 (MQ=255) cctcctTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAg > 1:26426861/1‑67 (MQ=255) cctcctTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAGc < 1:7363621/68‑1 (MQ=255) tCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACCGCCAGAAc > 1:3365527/1‑68 (MQ=255) tCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAGCCAGAAc > 1:18942081/1‑68 (MQ=255) 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tATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAGCCAGAACGCGCATATTTGACGCTTACCaa > 1:17478018/1‑68 (MQ=255) cGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAGCCAGAACGCGCATATTTGACGCTTACCaaaaa > 1:11520066/1‑68 (MQ=255) | CTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCTTTCACTTATCGGCATCGTGCTCCCACAGGTTCCGGCTACGCACAGCCAGAACGCGCATATTTGACGCTTACCAAAAA > CP009273/2161329‑2161463 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |