| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2955919 | 281 (0.600) | 16 (0.040) | 5/96 | NT | 6.0% | coding (205/324 nt) | ppdC | putative prepilin peptidase‑dependent protein |
| ? | CP009273 | = 2955921 | 260 (0.640) | coding (203/324 nt) | ppdC | putative prepilin peptidase‑dependent protein | |||||
Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
TGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTA > CP009273/2955854‑2955985 | tGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGt > 1:26310806/1‑68 (MQ=255) gAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGt < 1:20012690/67‑1 (MQ=255) gAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGt < 1:25023054/67‑1 (MQ=255) gAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGt < 1:1866807/67‑1 (MQ=255) gAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGt < 1:6263497/67‑1 (MQ=255) aaCTAGCGTAACGCTGATGCTGACTCATCCCGCCTGCGATGTCTTCATTCGGTTGACCTGCCAGTtg > 1:7181952‑M2/1‑65 (MQ=255) aGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTtggcagg > 1:38127528‑M2/1‑61 (MQ=255) aGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTtggcagg > 1:26985669‑M2/1‑61 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTgg < 1:12183688/68‑1 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg < 1:22982127/67‑1 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg > 1:5987468/1‑67 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg > 1:11006779/1‑67 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg > 1:24051779/1‑67 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg > 1:792824/1‑67 (MQ=255) gTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTg < 1:33303512/67‑1 (MQ=255) aaCGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTtggcaggtcaac > 1:12447488‑M2/1‑56 (MQ=255) aaCGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGc < 1:33018213/67‑1 (MQ=255) aaCGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGc < 1:29637411/67‑1 (MQ=255) tGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAAt < 1:36822902/67‑1 (MQ=255) tGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGGCTGCATTCGGGTGACCTGCCAGTtggcaggtcaaccgaa > 1:30032200‑M2/1‑51 (MQ=255) tGATGCTGACACACCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTtggcaggtcaaccgaa > 1:14389564‑M2/1‑51 (MQ=255) tGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATcgc < 1:4893689/67‑1 (MQ=255) gCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTtggcaggtcaaccgaatgcag > 1:35121970‑M2/1‑47 (MQ=255) gCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATcgcgc > 1:9665972/1‑68 (MQ=255) tGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCgcgcgc < 1:29589400/68‑1 (MQ=255) gACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCa < 1:10343529/68‑1 (MQ=255) gACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCa < 1:7585476/68‑1 (MQ=255) gACACAACCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTtggcaggtcaaccgaatgcagaca > 1:14060035‑M2/1‑44 (MQ=255) acacATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAg > 1:28092686/1‑68 (MQ=255) acacATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAg > 1:20680885/1‑68 (MQ=255) acacATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAg > 1:32090573/1‑68 (MQ=255) acacATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCCAAATCgagcgc > 1:22548084/1‑66 (MQ=255) acacATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTAGGTTGACCTCCCAGTTGGCAGGTCGAGAAATCGCGCGCAg > 1:7795627/1‑68 (MQ=255) acacATCCAGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCCAAATCGCGCGCAg > 1:22090328/1‑68 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGTCGAAATCGCGCGCAGt < 1:17935984/68‑1 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCgcgcgc < 1:34793663/65‑1 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGt > 1:35935425/1‑68 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGt > 1:17131379/1‑68 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGt > 1:39000796/1‑68 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGt < 1:18137988/68‑1 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGt < 1:35375823/68‑1 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGt < 1:32476931/68‑1 (MQ=255) cacaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGATGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGt < 1:17493302/68‑1 (MQ=255) acaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGtt > 1:7338078/1‑68 (MQ=255) acaTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGtt > 1:1134086/1‑68 (MQ=255) caTCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTg < 1:2898821/68‑1 (MQ=255) tCCCGCCTGCGATGGCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCg < 1:32832096/68‑1 (MQ=255) ccGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGtt > 1:20198509/1‑68 (MQ=255) cGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGttt > 1:24408697/1‑68 (MQ=255) cGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGttt > 1:11124794/1‑68 (MQ=255) ccTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGttt > 1:21870371/1‑66 (MQ=255) ccTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGttt > 1:86016/1‑66 (MQ=255) ccTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAAACGCGCGCAGTTGCGttt > 1:34522933/1‑66 (MQ=255) cTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTtgct < 1:15924204/68‑1 (MQ=255) cTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTtgct < 1:21497132/68‑1 (MQ=255) cTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTtgc < 1:37493276/67‑1 (MQ=255) cTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTtgc < 1:31225909/67‑1 (MQ=255) cTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCAt > 1:14918814/1‑68 (MQ=255) aTTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccg < 1:13873402/68‑1 (MQ=255) aTTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccg < 1:2375724/68‑1 (MQ=255) aTTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgcc < 1:3149272/67‑1 (MQ=255) ttCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccg > 1:5513809/1‑67 (MQ=255) ttCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccg > 1:14599396/1‑67 (MQ=255) ttCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccg > 1:10038015/1‑67 (MQ=255) ttCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccg > 1:27068518/1‑67 (MQ=255) ttCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCG‑TTGCTGCCAGCCATgccgcc > 1:26055443/1‑68 (MQ=255) tCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccgcc < 1:5232802/68‑1 (MQ=255) tCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATgccgcc < 1:11942288/68‑1 (MQ=255) gTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 1:944133/1‑68 (MQ=255) gTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 1:35565738/1‑68 (MQ=255) gTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 1:16511777/1‑68 (MQ=255) gTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 1:23927243/1‑68 (MQ=255) gTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 1:2542903/1‑68 (MQ=255) ttGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga < 1:2106875/67‑1 (MQ=255) tGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCagag < 1:19052830/67‑1 (MQ=255) tGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCaga > 1:8206883/1‑66 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTg < 1:13403065/67‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTg < 1:426507/67‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTg < 1:37753004/67‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTg < 1:3106241/67‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGt > 1:8956487/1‑68 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGt < 1:19316069/68‑1 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGt > 1:15580544/1‑68 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGt > 1:38586230/1‑68 (MQ=255) ccTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGt < 1:31865496/68‑1 (MQ=255) cTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGtt < 1:13198084/68‑1 (MQ=255) cTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGtt < 1:34972085/68‑1 (MQ=255) tGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTg < 1:33213586/68‑1 (MQ=255) cAGTTGGCAGGTGGCGTAATGGGGCGCAGTTTCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGTGCTGTTGGt < 1:30707199/67‑1 (MQ=255) 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ttGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGtt < 1:4401575/61‑1 (MQ=255) | TGAAACTAGCGTAACGCTGATGCTGACACATCCCGCCTGCGATGTCTGCATTCGGTTGACCTGCCAGTTGGCAGGTGGCGAAATCGCGCGCAGTTGCGTTTGCTGCCAGCCATGCCGCCAGAGCTGTTGGTA > CP009273/2955854‑2955985 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |