| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 254726 = | NA (NA) | 5 (0.020) | 4/94 | NT | NA | intergenic (+9/+30) | crl/phoE | RNA polymerase holoenzyme assembly factor crl/outer membrane phosphoporin protein E |
| ? | CP009273 | 254749 = | NA (NA) | intergenic (+32/+7) | crl/phoE | RNA polymerase holoenzyme assembly factor crl/outer membrane phosphoporin protein E | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TAATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/254801‑254726‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catccggcaATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTGT > CP009273/254749‑254814 TAATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGC < 1:13657982/68‑1TAATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCAGATGTGATGC < 1:6919529/68‑1 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTTATGCA > 1:11045992/1‑68 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA > 1:23694260/1‑68 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA > 1:9035971/1‑68 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA > 1:7609005/1‑68 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA > 1:27917559/1‑68 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA > 1:26685926/1‑68 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA > 1:21564878/1‑68 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA < 1:14153838/68‑1 AATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCA > 1:13248095/1‑68 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:3570272/68‑1 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:29175407/68‑1 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:26467029/68‑1 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:15108622/68‑1 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:26135414/68‑1 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:25424866/68‑1 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:20600835/68‑1 ATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT < 1:19803856/68‑1 TAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT > 1:13351498/1‑67 TAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT > 1:7882661/1‑67 TAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT > 1:7742951/1‑67 TAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT > 1:7742943/1‑67 TAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT > 1:4533935/1‑67 TAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCAT > 1:26267700/1‑67 AATGATGATATTGTCGCGGTTTGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCC > 1:10603731/1‑68 AATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCC > 1:14809940/1‑68 AATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCC > 1:17831966/1‑68 AATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCC > 1:3687969/1‑68 AATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTAGCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCC > 1:11510631/1‑68 AATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGAAGTATCAGTTTTAATTAATATTGCCGGATGTGATGCATCa > 1:24807997/1‑67 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG < 1:15955296/68‑1 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:15060798/1‑68 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:24537435/1‑68 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG < 1:23998791/68‑1 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:102628/1‑68 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:22600421/1‑68 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG < 1:13214279/68‑1 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:4129427/1‑68 ATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:14408769/1‑68 TGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGG < 1:28785093/68‑1 TGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGG < 1:27627894/68‑1 TGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGG < 1:3888670/68‑1 TGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGG < 1:5709385/68‑1 TGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:28611809/1‑67 TGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:26550113/1‑67 TGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCG > 1:22218632/1‑67 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:2659276/1‑68 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:24953687/1‑68 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC < 1:5798815/68‑1 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:24172196/1‑68 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:23768305/1‑68 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC < 1:1813087/68‑1 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:23683473/1‑68 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:12130189/1‑68 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:2814543/1‑68 GATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGC > 1:28528650/1‑68 GGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGCAATATTCATTAAAA < 1:15621226/68‑1 TTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGCAATATTCATTAAAAC < 1:10808327/67‑1 TTGGCAGGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGCTGTGATGCATCCGGCAATATTCATTAAAACT < 1:13722175/68‑1 TGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGCAATATTCATTAAAACTG < 1:2861367/68‑1 TGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGCAATATTCATTAAAACT < 1:26739791/67‑1 ATCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCA > 1:4153200/1‑68 ATCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCA > 1:2836203/1‑68 ATCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCA > 1:21048650/1‑68 ATCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCA > 1:17629894/1‑68 ATCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATAATCATTATTAATATTCA > 1:4063433/1‑68 ATCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCG < 1:19077790/43‑1 TCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAA > 1:15167578/1‑68 TCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAA > 1:28547019/1‑68 TCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAA > 1:20819621/1‑68 TCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAA > 1:7140338/1‑68 TCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAA > 1:25009219/1‑68 TCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAA > 1:13873172/1‑68 TCCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAA > 1:25562865/1‑68 CCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAAT < 1:6521222/68‑1 CCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAAT < 1:16117971/68‑1 CCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAAT < 1:19187394/68‑1 CCGGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAAT < 1:11390428/68‑1 GGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTT < 1:13870253/68‑1 GGCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTT < 1:23525092/68‑1 GCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTG > 1:8277957/1‑68 GCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTG > 1:1542240/1‑68 GCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTG > 1:19073649/1‑68 GCAATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTG > 1:10976609/1‑68 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1:6733513/67‑1 AATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTGT < 1:14328709/67‑1 AATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTGT < 1:16856190/67‑1 AATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTGT < 1:15874797/67‑1 TAATAATGATGATATTGTCGCGGTTGGCATGACGTATCAGTTTTAATGAATATTGCCGGATGTGATGCATCCGGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/254801‑254726‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑catccggcaATATTCATTAAAACTGATACGTCATGCCAACCGCGACAATATCATCATTATTAATATTCAATTTGT > CP009273/254749‑254814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |