| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 282361 | 239 (0.680) | 15 (0.050) | 8/92 | NT | 5.1% | coding (1256/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| ? | CP009273 | = 282393 | 366 (1.260) | coding (1288/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter | |||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/282286‑282361‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acgcgggcatCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < CP009273/282393‑282328 GCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC > 1:12256996/1‑68 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGC > 1:27698416/1‑68 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGC > 1:27698407/1‑68 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGC > 1:13212550/1‑68 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACG < 1:17983757/67‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:769963/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:2608071/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:18623292/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGGGGTGCTCTAC < 1:13572084/66‑1 GTGCAGCCGGGTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:9003167/66‑1 GCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGG < 1:20664074/68‑1 GCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCG < 1:14590894/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:25535654/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:12983889/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:11054622/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:16204677/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:14286315/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:4865751/67‑1 AGCCGGGTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGGGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:7201691/67‑1 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:18635298/1‑68 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:7882862/1‑68 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:14070662/1‑68 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGGGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:23729624/1‑68 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT < 1:18530176/67‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT < 1:18315326/67‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT < 1:1722361/67‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA < 1:6785690/66‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA < 1:15331060/66‑1 CGGTGGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTGCTGCGGGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA < 1:15782345/66‑1 TGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCT < 1:27700516/67‑1 TGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCT < 1:13278777/67‑1 TGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCT < 1:26382475/67‑1 ACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCG > 1:12661755/1‑68 TCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAG < 1:10894385/68‑1 CAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGC < 1:10224043/68‑1 CAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGC < 1:21684891/68‑1 CAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCCACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGC < 1:2431515/68‑1 ctcTTCTGCGTGGGGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGA < 1:21541903/65‑1 CTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGA < 1:7980403/68‑1 CTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGA < 1:11929746/68‑1 GCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCC < 1:8927096/68‑1 ACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCA > 1:12598391/1‑67 ACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCA > 1:5023829/1‑67 ACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCA > 1:14835312/1‑67 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:21327628/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:4417712/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:19760475/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:8706012/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:25585821/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:8092915/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:29073861/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:14371970/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:14706643/1‑68 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCCCCGGCACC > 1:27007428/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:17134376/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:10277123/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:6453376/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:12755174/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:1492229/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:27361417/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:18351776/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:25165743/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:19378752/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:19420433/1‑67 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCCCCGGCACCAC > 1:140205/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:8300111/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:20271309/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:20097591/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:2187148/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:23141725/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:15536440/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:24078204/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:17498769/1‑68 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:24715250/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:20477185/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:1094730/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:14583227/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:4025442/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:18840736/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:2888036/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:25772168/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACAGGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:5074244/67‑1 GGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC > 1:4040014/1‑68 GGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC > 1:10477252/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:29197843/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:19218691/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:25358535/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:11136381/1‑68 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:9125554/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:9563475/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:9270448/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:5194531/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:27171885/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:24536462/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:21437976/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:21386782/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:21176699/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:19688343/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:16521789/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:16425403/68‑1 GCGTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/282286‑282361‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acgcgggcatCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < CP009273/282393‑282328 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |