| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 282361 | 239 (0.680) | 15 (0.050) | 8/92 | NT | 5.1% | coding (1256/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
| ? | CP009273 | = 282393 | 366 (1.260) | coding (1288/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter | |||||
Only 100 of 491 total aligned reads displayed.
GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTC > CP009273/282326‑282459 | gttctgCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCg > 1:23323214/1‑68 (MQ=255)gttctgCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCg > 1:6070192/1‑68 (MQ=255) tCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGat < 1:21437976‑M2/68‑3 (MQ=255) tCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGat < 1:5194531‑M2/68‑3 (MQ=255) tCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGat < 1:2683001‑M2/68‑3 (MQ=255) cTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatg > 1:11136381‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatg > 1:29197843‑M2/1‑65 (MQ=255) gCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcc > 1:4040014‑M2/1‑63 (MQ=255) gtggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccg > 1:24078204‑M2/1‑61 (MQ=255) gtggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccg > 1:20645297‑M2/1‑61 (MQ=255) gtggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgccc < 1:1094730‑M2/67‑7 (MQ=255) gtggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgccc < 1:24715250‑M2/67‑7 (MQ=255) ggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgcg > 1:19760475‑M2/1‑59 (MQ=255) ggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgcg > 1:7016472‑M2/1‑59 (MQ=255) ggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgcg > 1:8092915‑M2/1‑59 (MQ=255) ggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgc > 1:18351776‑M2/1‑59 (MQ=255) ggtgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgc > 1:17134376‑M2/1‑59 (MQ=255) tgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgcgt > 1:12598391‑M2/1‑57 (MQ=255) tgCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgcgt > 1:14835312‑M2/1‑57 (MQ=255) ggtggtGCTCTACGCTGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAgg < 1:7367780/68‑1 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGcc > 1:9578067/1‑68 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGcc > 1:28190907/1‑68 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGcc > 1:27798610/1‑68 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGcc > 1:22650763/1‑68 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGcc > 1:8305235/1‑68 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGcc > 1:7729409/1‑68 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGcc > 1:15305352/1‑68 (MQ=255) tggtgCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGc > 1:12974186/1‑67 (MQ=255) 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gcgGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCa > 1:3425697/1‑68 (MQ=255) gcgGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCa > 1:2882524/1‑68 (MQ=255) cgGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCa > 1:26395979/1‑67 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCGGCTGa > 1:27248983/1‑68 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTg < 1:27096198/67‑1 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTg < 1:11594653/67‑1 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGa > 1:25875184/1‑68 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGa > 1:10115398/1‑68 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGa > 1:25039710/1‑68 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGa > 1:28414082/1‑68 (MQ=255) cATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGa > 1:13140732/1‑68 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:17404814/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:3816101/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:23581950/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:26615996/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:15115536/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:10555670/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:19560670/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:25652177/68‑1 (MQ=255) aTGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGAt < 1:25539750/68‑1 (MQ=255) tcatcaTGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTaa > 1:2533995/1‑67 (MQ=255) tcatcaTGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTaa > 1:18819661/1‑67 (MQ=255) tcatcaTGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTaa > 1:10010965/1‑67 (MQ=255) tcatcaTGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTaa > 1:5034707/1‑67 (MQ=255) catGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAcc > 1:6456574/1‑68 (MQ=255) atGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAcc > 1:4114109/1‑67 (MQ=255) atGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAcc > 1:8407434/1‑67 (MQ=255) atGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAcc > 1:5665478/1‑67 (MQ=255) atGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAcc > 1:16563038/1‑67 (MQ=255) atGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAcc > 1:465994/1‑67 (MQ=255) atGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCAcc > 1:2046989/1‑67 (MQ=255) tGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACcgc > 1:23882074/1‑68 (MQ=255) gCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGatgcccgcgtagagcaccaccggcaccacgcagaacagaattttg < 1:10224043‑M2/68‑46 (MQ=255) gCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCTCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACcgc > 1:17891010/1‑67 (MQ=255) gCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACcgc > 1:16829240/1‑67 (MQ=255) gCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACcgc > 1:5367491/1‑67 (MQ=255) gCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACcgc > 1:24398742/1‑67 (MQ=255) gCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACcgc > 1:14513477/1‑67 (MQ=255) gCTGTCGCTCTACAAGCTCACAGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACagc > 1:12234107/1‑67 (MQ=255) cTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACcgcgc > 1:9096931/1‑68 (MQ=255) 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aGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAg > 1:15590083/1‑68 (MQ=255) aGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAg > 1:2176355/1‑68 (MQ=255) aGCTCACCGATGCCAGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAg > 1:9351263/1‑68 (MQ=255) cTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCTCGCCGCGCAGGGCGAgg > 1:3687353/1‑67 (MQ=255) cTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAgg > 1:9763530/1‑67 (MQ=255) cTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAgg > 1:28605212/1‑67 (MQ=255) cTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAgg > 1:19040345/1‑67 (MQ=255) cTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAgg > 1:19344387/1‑67 (MQ=255) cTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAgg > 1:20183332/1‑67 (MQ=255) cACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCg > 1:21095357/1‑68 (MQ=255) cACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCg > 1:23018578/1‑68 (MQ=255) gATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTc > 1:13910041/1‑67 (MQ=255) | GTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATGTTCATCATGCTGTCGCTCTACAAGCTCACCGATGCCCGCGTGGAGGCCATCAGCCGGCAGCTGATTAAGCACCGCGCGGCGCAGGGCGAGGCCGTTC > CP009273/282326‑282459 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |