| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3015939 | 437 (1.240) | 24 (0.080) | 12/96 | NT | 6.4% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| ? | CP009273 | = 3015996 | 324 (1.070) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding | |||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3015865‑3015939‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccaACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCG < CP009273/3015996‑3015932 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:10124021/1‑68CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC < 1:12359134/68‑1CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:25631985/1‑68 TGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG < 1:890573/68‑1 TGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:27209072/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACa > 1:4229137/1‑66 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:27531408/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:18442982/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:20553349/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:20814164/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:14356084/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:1414419/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:2178964/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:2453628/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:5008596/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:6128571/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:6311311/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:10285757/1‑67 TTTACTCGTATTGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:28068551/67‑1 TTTACTCGTATGGTCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:9728463/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:13385281/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:15117584/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:6797728/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:13601639/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11208064/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11575065/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:6000441/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:23056691/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:23733840/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:15941952/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:25480350/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:13174390/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11758709/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:413394/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:12616173/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:27700711/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:1195084/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:16136305/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:18946322/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:16224578/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:1707319/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:15837569/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:18002388/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:18569256/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:16789650/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:18039542/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:9453738/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:1834338/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGACACTTACGCC < 1:5697055/67‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:5314145/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:9235347/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCG > 1:18922552/1‑67 TACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCC > 1:4599648/1‑68 ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:6770393/1‑68 TCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:26435093/1‑66 CACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGCTCGCGCTTTAAGGACATGAACTTTAT > 1:18399793/1‑66 ACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACAGGAACGTTAT > 1:28476304/1‑65 CCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACGTTATGCTGTT > 1:15040375/1‑68 CCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCGCTTTAATGACATGATGGTTATGCTGTT > 1:19587227/1‑68 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCCACGCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGC > 1:2976008/1‑67 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGC > 1:8524014/1‑67 GGTACCATGGCACTTACGCCGGCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCTTGCCCAC > 1:24054769/1‑68 GGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACGTTATGGTGTTTCATGCCCAC > 1:19182027/1‑68 GTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACG > 1:26500708/1‑68 TACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGA > 1:5743391/1‑68 TACCATGGCACTTACGCAGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGA > 1:5543812/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCGACTCGGTCTTTAATGCCATGAACTTTACGCTGTTTAATGCCCACGAG > 1:8786281/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:17879206/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:7193932/1‑68 TGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGTCATGAACTTGTTGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:10571941/1‑68 GGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:22949404/1‑67 GGCACTTACGCCACCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:9721031/1‑67 GCACTTACGCCGCCAACTCGGTCGTTAATGACATGACCTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGC > 1:11720630/1‑68 aaaACGCCGCCAACTCGCGCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGAC < 1:21690704/65‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:21809177/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:12935725/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:11181226/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:20189432/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:8535584/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATAAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTG > 1:5075265/1‑67 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATCACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:26187473/68‑1 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC > 1:28955465/1‑68 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC > 1:22611553/1‑68 CGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGG < 1:20569152/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |