| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3015939 | 437 (1.240) | 24 (0.080) | 12/96 | NT | 6.4% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| ? | CP009273 | = 3015996 | 324 (1.070) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding | |||||
Only 100 of 573 total aligned reads displayed.
ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 | cTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAg < 1:4867407/68‑1 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACTATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:13042072/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:25041825/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:10833576/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:18045734/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:28476963/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:663184/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:7097571/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATACACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACATACGCCGCCAgg > 1:9192691/1‑68 (MQ=255) tATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTc > 1:14979953/1‑67 (MQ=255) tGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgc > 1:28196520/1‑67 (MQ=255) ggACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgc > 1:7271513/1‑68 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:4147657/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:18465401/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg < 1:21431322/67‑1 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:23682242/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:25792967/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:11276445/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCgcgcgc > 1:19633895/1‑68 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:13108492/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:15969656/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:5379303/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:27306993/68‑1 (MQ=255) ggCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc > 1:3768056/1‑67 (MQ=255) cGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:6361660/67‑1 (MQ=255) gATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCg < 1:24409985/67‑1 (MQ=255) gATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCg < 1:13792268/67‑1 (MQ=255) tCGTCTGGTTATCCACGCCTCAACCCAGTTACAATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTgg < 1:12789328/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:16634139/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:4701291/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:22124483/68‑1 (MQ=255) tGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATg < 1:15792480/68‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCTCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:20811130/67‑1 (MQ=255) tATCCACGCCTCCCCCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAAc > 1:6097710/1‑68 (MQ=255) aTCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaaaga > 1:15390125/1‑66 (MQ=255) aTCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAAcc > 1:20560346/1‑67 (MQ=255) tCCACGCCTCCTCCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAg < 1:18228651/68‑1 (MQ=255) tCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAg < 1:16467688/68‑1 (MQ=255) tCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAg < 1:13372121/68‑1 (MQ=255) tCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAg < 1:23934584/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:17293488/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:15072955/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:24056709/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTAACATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:10634167/68‑1 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:10049548/1‑68 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:26089608/1‑68 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:5678457/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt > 1:26752718/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt > 1:2163179/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt > 1:7511369/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:23107198/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:19009967/1‑68 (MQ=255) ctcctcCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAg > 1:28730122/1‑68 (MQ=255) cTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAg < 1:19970363/68‑1 (MQ=255) cTCCACCCAGGTACCAAGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa < 1:3440901/67‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:12318175/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACCCCGCCAGGTCGCTCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:29223227/68‑1 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgc > 1:8524014‑M1/1‑27 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:27888674/1‑68 (MQ=255) 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tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:26372758/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:14038155/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:211572/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:9558596/65‑1 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCCactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgag > 1:27654181‑M1/1‑21 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:16948353/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:11086608/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:23462955/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:24291842/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:26995621/1‑68 (MQ=255) 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gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:20338813‑M2/68‑5 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:1189037‑M2/68‑5 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:2951201‑M2/68‑5 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATCAAAGAGCGAGTtggc < 1:25639996‑M2/68‑5 (MQ=255) cgccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcg < 1:5182910‑M1/67‑63 (MQ=255) gccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggc > 1:28955465‑M2/1‑61 (MQ=255) ccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgaccacgaggcgcgcgacatggcggcg > 1:8584264‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg < 1:20189432‑M2/68‑9 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg < 1:21809177‑M2/68‑9 (MQ=255) cAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcg < 1:7831839‑M1/67‑66 (MQ=255) cAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGcggcgg < 1:26008127/68‑1 (MQ=255) | ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |