| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3060669 = | 345 (0.980) | 12 (0.040) | 9/92 | NT | 5.0% | intergenic (‑137/+30) | ygfI/yggE | putative DNA‑binding transcriptional regulator/oxidative stress defense protein |
| ? | CP009273 | 3060693 = | 170 (0.590) | intergenic (‑161/+6) | ygfI/yggE | putative DNA‑binding transcriptional regulator/oxidative stress defense protein | |||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TAGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3060745‑3060669‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtcgggctaCAAATATTATTGTGCTGCAGGTGTTTTAGCGGGTTGTTGATCCACAGGTTCTAACTGGAAGACCACA > CP009273/3060693‑3060759 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:20989097/68‑1 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:20426288/68‑1 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:10823015/68‑1 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:16928968/68‑1 AGAACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCG < 1:25027632/68‑1 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:26029944/1‑68 ACCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCG > 1:4136216/1‑68 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CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:11729210/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:12322486/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:12015758/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:15534365/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:1581038/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:16390233/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:27027670/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:7813865/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:9252222/1‑68 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG < 1:948141/68‑1 CCTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGG > 1:6614087/1‑68 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CTGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:8994119/68‑1 CTGGGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGG < 1:554861/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTGTTCGTCtg > 1:29258447/1‑64 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:8244355/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:9741553/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:11001615/68‑1 TGTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGC < 1:10561392/68‑1 GTGGATCAACAACCCGCTAAACCACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCT < 1:1866071/68‑1 GTGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCT < 1:22987400/68‑1 TGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA > 1:10133979/1‑68 TGGATCAACAACCCGCTAAAACACCTGCAGCACAATAATATTTGTAGCCCGACGTATTCGTCGGGCTA > 1:20421838/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |