| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 253 | 321 (0.910) | 18 (0.060) | 8/92 | NT | 5.6% | coding (64/66 nt) | thrL | thr operon leader peptide |
| ? | CP009273 | = 278 | 338 (1.170) | intergenic (+23/‑59) | thrL/thrA | thr operon leader peptide/Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 1 | |||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
GTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/177‑253‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtgcgggctTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGGTGGTA < CP009273/278‑213 GTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACG > 1:28188498/1‑68GTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACAAACATTACAACCACCATCACCATTACCACAGGTAACG > 1:28585868/1‑68 ACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGT < 1:10887196/68‑1 ACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGG < 1:2689266/67‑1 CAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCG > 1:7016816/1‑68 CAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCG > 1:21911018/1‑68 CAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCG > 1:8695945/1‑68 CAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCG > 1:6904846/1‑68 CAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCG > 1:24644421/1‑68 ACATCCATGAAACTCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGG < 1:20340655/68‑1 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCCCCATTACCACCACCATCACAATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:23423376/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACGACAGGTAACGGTGAGG > 1:27926744/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:9130959/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:20791090/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:9282353/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:22302753/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:22501247/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:18622303/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:18052947/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:17802090/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:17627544/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:23678965/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:17101829/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:11417180/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:598565/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:15712643/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:27243662/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:15196074/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:27498117/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:12264716/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:5026325/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:396386/1‑67 ACATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:13198847/1‑67 ATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:5508760/1‑65 ATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:10062680/1‑65 ATCCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCAACACCATTACCACAGGTAACGGTGCGG > 1:10267003/1‑65 CCATGAAACGCATTAGCACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGT < 1:19142407/59‑1 ACCACCATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGGTTTTTTCTGTGTGTCCTGT > 1:4424914/1‑67 CACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTT > 1:1198131/1‑67 GGTGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGG > 1:28518676/1‑68 GGTGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGG > 1:25132887/1‑68 GTGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGT > 1:23537288/1‑68 GTGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGT > 1:21511123/1‑68 GTGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGT > 1:21250499/1‑68 gGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGT < 1:2650561/66‑1 TGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGT < 1:13964772/67‑1 TGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGT < 1:18799294/67‑1 TGCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGG < 1:16398569/66‑1 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:7612367/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:3738128/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:14874596/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:19781293/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:19370359/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:13719284/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:8144030/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:12830533/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:7718080/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:20963580/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:11767100/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:22691945/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:6555338/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:6732590/1‑68 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG < 1:21967748/68‑1 GCGGGCTTTTTTCTGTGTTTCCTGTACGCGTCAGCCCGCACCGTTACCTGTGGTAATGGTGATGGTGG > 1:11490475/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |