| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 211 (0.600) | 16 (0.060) | 7/92 | NT | 5.5% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 379 (1.310) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501947‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG < 1:5484946/68‑1CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG < 1:16755564/68‑1CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:14214002/1‑68CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:13770999/1‑68 CTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGC < 1:23670159/68‑1 CTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGC < 1:14244744/68‑1 CTGTGGGGGCGCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGAGGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGC < 1:14244759/68‑1 tgcGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGAGGGTGCTGCCGCTGCGGGCCTTTGCGGGCG < 1:18318705/65‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:9131650/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:27235002/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:2760165/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:29095529/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:25417442/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:1398320/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:12066689/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 1:25395620/1‑67 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 1:21331911/1‑67 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 1:18983517/1‑67 cGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGGGATGGGGCTGCCGCGGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:14003315/66‑1 GGGGTCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:8930183/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:779744/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:27624414/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:25468285/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:16740933/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:19501818/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:25385440/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:17950064/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:779732/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:5513405/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:5670427/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGACGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA > 1:4448724/1‑68 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGAAGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:18944405/67‑1 GGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 1:20841135/1‑68 GGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 1:5848286/1‑68 GGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT > 1:24861536/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:19083439/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT < 1:1271321/67‑1 GGGCGCTACTTCTTCTGCCGTCAGTGCCCGGGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:12141844/68‑1 GGCTCTACTTGTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:6931939/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:13033623/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:26611946/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:29203388/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:26415188/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:2928602/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:6410932/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:13004553/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:29065059/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:17938730/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:24463328/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:408695/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:8554070/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:6173506/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:27104371/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:1279997/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:22097126/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:1883158/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:5548236/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:5591617/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:1892679/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:20927749/1‑67 GGCGCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:6400356/1‑67 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:9382956/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:791081/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:5200868/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:6021725/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:6757200/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:6790083/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:270001/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:17124033/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:23648349/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:21358609/67‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGCTGGTGCTGCCGCTGCGGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:21345939/68‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:13102459/68‑1 ACTTCTTATGCCGGCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:11573415/68‑1 ctcCTTATCCCGTCACTGCCCGTGAGGGTGCGGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACAC < 1:1803708/65‑1 ATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCGGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAA < 1:14262011/68‑1 ATGCCGGCACTGCCCGGGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAA < 1:16513901/68‑1 GCCGTCACTGCCCGAGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATA < 1:5685340/68‑1 CGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATAT < 1:5711678/67‑1 CACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGG < 1:26922942/68‑1 cccGCCCGTGAAGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGG < 1:19057328/64‑1 CCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:21614704/67‑1 cggGATGGTGCTGCCGCGGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:12321343/65‑1 cggGATGGGGCGGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:13572529/65‑1 CGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:18555864/68‑1 CGTGATGGTGCTGCCGCGGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:22437613/68‑1 CGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:22883036/68‑1 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAC > 1:27298011/1‑67 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAC < 1:16295437/67‑1 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGC < 1:11304050/68‑1 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:2186491/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:24361038/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:2632021/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:10214929/1‑67 ATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCG < 1:9295724/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:16168862/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:9284702/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCAAGAGGGTTGCGCACAATCCCATGTATCAGCACGCCCGC < 1:26420826/68‑1 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC < 1:1448367/68‑1 CTCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501947‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |