| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 211 (0.600) | 16 (0.060) | 7/92 | NT | 5.5% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 379 (1.310) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 468 total aligned reads displayed.
AGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501900‑4502033 | aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:25032747/1‑68 (MQ=255) aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:8501673/1‑68 (MQ=255) aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac < 1:25121967/68‑1 (MQ=255) aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac > 1:285823/1‑68 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:29222410/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:13265203/68‑1 (MQ=255) acttcttatgccgtcactgcccgtgctggtgctgccgctgcgggcctttgcgggcggcatggTTAaca < 1:21345939‑M2/6‑1 (MQ=255) aTCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACAcc < 1:5038908/68‑1 (MQ=255) cACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCga > 1:11270678/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:19110852/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:28070050/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCAAAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:11502672/68‑1 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCCCAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACCCCGAGAata > 1:25818090/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:21639879/1‑68 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat > 1:26466332/1‑67 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat < 1:12791024/67‑1 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat < 1:7157349/67‑1 (MQ=255) aGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAatat > 1:3103654/1‑67 (MQ=255) gACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCgg < 1:3844274/68‑1 (MQ=255) gACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCgg < 1:10907262/68‑1 (MQ=255) gACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCgg > 1:7386087/1‑68 (MQ=255) gACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCg < 1:18788277/67‑1 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:4467250/1‑68 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:11225710/1‑68 (MQ=255) cGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTg > 1:18846528/1‑68 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:18482593/68‑1 (MQ=255) cgggatggggcggccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:13572529‑M2/27‑1 (MQ=255) gaagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCaga > 1:4065488/1‑68 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGCTGCCagag > 1:4539355/1‑68 (MQ=255) aagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCagag > 1:26727889/1‑68 (MQ=255) agTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAgg > 1:23324539/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:18363399/1‑68 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:22753718/1‑68 (MQ=255) tAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt > 1:16475241/1‑68 (MQ=255) tAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTAAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt > 1:3706551/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg < 1:8228339/66‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg < 1:4867642/66‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:20568602/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:10609201/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:8651906/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:923140/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:12232855/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:16974751/1‑68 (MQ=255) agagCCACCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:5519292/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:13648394/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:15943967/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:27046778/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:25462639/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:23674879/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:18558508/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:9822437/1‑68 (MQ=255) gCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:15595193/1‑67 (MQ=255) gCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:2008102/1‑67 (MQ=255) gCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:10130822/1‑67 (MQ=255) gCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc < 1:22579296/67‑1 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc < 1:15850295/67‑1 (MQ=255) cccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGcac < 1:5702357/68‑1 (MQ=255) ccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGcaca < 1:23958088/68‑1 (MQ=255) cacaGTGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa < 1:3433877/68‑1 (MQ=255) cacaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:1303371/1‑68 (MQ=255) acaGAGGCCTGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGGTGCGCACAAt < 1:14352095/68‑1 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:7893094/1‑67 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTACCACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:13901931/1‑67 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGcacatt > 1:9045575/1‑65 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:11627448/1‑67 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:17577387/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTTCGCACAATc > 1:11755534/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:2119003/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:3544238/1‑67 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCTTGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:5284214/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccccg > 1:17218704/1‑67 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:1446707/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:17968792/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:27378396/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:20795216/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:12517960/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:9388365/1‑65 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCt < 1:14908325/66‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCt < 1:1921425/66‑1 (MQ=255) ccAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt > 1:6616842/1‑68 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:7579905/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:28866439/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:14636972/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:1959057/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:21740225/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:22348445/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:22997342/67‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATc > 1:19986953/1‑68 (MQ=255) ggCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATc > 1:16634915/1‑68 (MQ=255) gCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:11938964/1‑68 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:4256054/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:9436932/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:24827401/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:1632397/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa < 1:2764508/67‑1 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:14058802/1‑67 (MQ=255) tGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAg < 1:6083307/67‑1 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg > 1:24361038‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg > 1:2632021‑M2/8‑67 (MQ=255) ttAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:2315188/44‑1 (MQ=255) | AGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501900‑4502033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |