New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4506708 = | 289 (0.820) | 21 (0.070) | 7/94 | NT | 8.4% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
? | CP009273 | 4506742 = | 215 (0.730) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCG < 1:10185027/68‑1 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCC < 1:20920265/67‑1 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCC < 1:16764988/67‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGC < 1:5809247/68‑1 AAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCG > 1:20965018/1‑67 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:22546907/68‑1 AACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCC < 1:10341141/68‑1 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:5142231/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:10757724/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:16866479/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:27735026/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:16904957/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:3566452/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:23479203/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:4095400/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:22893795/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:13705934/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:11522026/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:13432495/1‑68 ACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCG > 1:21968432/1‑68 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT > 1:12448410/1‑68 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT > 1:2991271/1‑68 CCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT > 1:13166529/1‑68 CCGCTGGGGGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGT < 1:14587023/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGGCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:5270626/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:15449645/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:18178712/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:26420006/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:15863530/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:8871175/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:4666163/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:5195754/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:12684986/68‑1 CGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT < 1:8684281/68‑1 GCTGGGTGAGGTGATCGCCACGCTAACCCGTTCCCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:6675204/1‑67 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:26530347/1‑67 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:9254904/1‑67 GCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTT > 1:1760645/1‑67 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCG < 1:16848191/68‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCG < 1:8532386/68‑1 TGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC < 1:7804554/67‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:26454214/68‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:16584900/68‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:18230189/68‑1 GGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGG < 1:5649059/68‑1 TGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTA < 1:21242297/67‑1 TGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTA < 1:24500055/67‑1 gggGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGGGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGG < 1:4334817/65‑1 GGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACG < 1:20723938/67‑1 cGATAGCCACGCTAACCCGTTCCCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGG < 1:21345842/65‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGG < 1:13557400/67‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGG < 1:21607904/67‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGG < 1:8063701/67‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGG < 1:18783533/66‑1 TGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGCTGCGGTAACGG < 1:15960083/66‑1 TGATAGCCACGCAAACCCGTCACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGAAACGG < 1:2730080/66‑1 tacCCACGCAAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAG < 1:2212011/65‑1 ACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGG < 1:15629836/68‑1 ACGCTAACCCGTAACCCCAACGGCGTGCAGCGCTGCGATCCCGCCGCTGCGGTAACGGGTTAGCGTGG < 1:25013648/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:15046186/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:14403225/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:10512419/68‑1 CGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:25964638/68‑1 CGCTAACCCGTCACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:20434732/68‑1 CGCAAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGC < 1:4466179/68‑1 AACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATC < 1:17714760/68‑1 CGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCCCCGTTGCGGAAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:15548112/68‑1 CGGCGGGCTGCGCGGCGATCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGT < 1:22559616/68‑1 GCCGTTGCGGTAAGGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:13117712/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:17440577/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:3337475/68‑1 GCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT < 1:3648902/68‑1 CCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGT > 1:15314487/1‑67 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:25932403/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:14741840/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:22523728/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:3201085/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:6288709/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:27297832/68‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTC < 1:5524703/67‑1 CGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACC‑CACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCC < 1:10002154/67‑1 GTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCT > 1:4511772/1‑68 GTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCT > 1:6666515/1‑68 GTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCT > 1:20286891/1‑68 GTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCT > 1:19779116/1‑68 TGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTC > 1:21410823/1‑68 TGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTC < 1:12454477/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:28386347/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:13464017/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:25166395/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:24915142/68‑1 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > 1:17061928/1‑68 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > 1:8850536/1‑68 GCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG < 1:19741876/68‑1 TAAACCGCTGGGTGAGGTGATAGCCACGCTAACCCGTTACCGCAACGGCGTGCTGCGCTGCGATCCCGCCGTTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4506782‑4506708 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCG > CP009273/4506742‑4506807 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |