| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4506708 = | 289 (0.820) | 21 (0.070) | 7/94 | NT | 8.4% | coding (827/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator |
| ? | CP009273 | 4506742 = | 215 (0.730) | coding (793/954 nt) | fecR | FecI pro‑sigma factor; transmembrane signal transducer for ferric citrate transport; periplasmic FecA:ferric citrate sensor and cytoplasmic FecI ECF sigma factor activator | |||||
Only 100 of 413 total aligned reads displayed.
TTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGT > CP009273/4506675‑4506808 | ttCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCg < 1:6400522/68‑1 (MQ=255)tgggtgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcg < 1:8532386‑M2/1‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:17369795/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:1574347/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:12046319/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:25333331/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:24859422/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:22977692/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:7141948/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:7513803/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg < 1:23715316/68‑1 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:14951797/1‑68 (MQ=255) tCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCgg > 1:28407508/1‑68 (MQ=255) gggtgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcgg < 1:18230189‑M2/2‑1 (MQ=255) tgaggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTa < 1:24500055‑M2/4‑1 (MQ=255) ggtgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACg < 1:20723938‑M2/7‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:26569434/67‑1 (MQ=255) gAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACgg < 1:2919383/67‑1 (MQ=255) tgatagccacgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgctgcGGTAACgg < 1:15960083‑M2/8‑1 (MQ=255) cgatagccacgctaacccgttcccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACgg < 1:21345842‑M2/8‑1 (MQ=255) gatagccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGtt < 1:17714760‑M1/45‑1 (MQ=255) tacccacgcaaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACGGGTTAg < 1:2212011‑M2/13‑1 (MQ=255) gTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAg < 1:26997193/68‑1 (MQ=255) tCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc > 1:16316347/1‑68 (MQ=255) gccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg < 1:14403225‑M1/49‑1 (MQ=255) gccacgctaacccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg < 1:10512419‑M1/49‑1 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc < 1:24673321/67‑1 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGc < 1:19474151/67‑1 (MQ=255) cccGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCg > 1:4698753/1‑68 (MQ=255) ccacgctaacccgttaccGCAGCGGCGGGATCGCAGCGCTGCACGCCGTTGGGGTTACGGGTTAGCGt < 1:25013648‑M1/50‑1 (MQ=255) gCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTgg < 1:17080371/68‑1 (MQ=255) cgctaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:25964638‑M2/19‑1 (MQ=255) cgctaacccgtcaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:20434732‑M2/19‑1 (MQ=255) cgcaaacccgttaccgcaacggcgtgctgcgctgcgatcccgccgttgcGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:4466179‑M2/19‑1 (MQ=255) cTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTg > 1:7799739/1‑66 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGc < 1:26730122/67‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCt > 1:26240390/1‑68 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:23812288/1‑67 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:13207843/1‑67 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:1546406/67‑1 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:19877847/1‑67 (MQ=255) cgcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:6246313/67‑1 (MQ=255) cccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:8063701‑M1/58‑1 (MQ=255) cccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:21607904‑M1/58‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:6605443/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:28956844/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcac < 1:28693462/67‑1 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca > 1:323123/1‑66 (MQ=255) gcAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTAGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAaca > 1:12924859/1‑66 (MQ=255) ccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCCCGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGctatcccc < 1:4334817‑M1/60‑4 (MQ=255) ccgttaccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtca < 1:18783533‑M1/58‑1 (MQ=255) taccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca < 1:21242297‑M1/63‑1 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:24204277/1‑67 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:16738481/1‑67 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:28274188/1‑67 (MQ=255) cccGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTAtcacctca > 1:27299789/1‑67 (MQ=255) ccGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCAccc < 1:26454214‑M1/66‑1 (MQ=255) AACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGc > 1:9254904‑M1/1‑67 (MQ=255) AACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCg < 1:8871175‑M1/68‑1 (MQ=255) 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TTCAGCGGGAACGTCCCGCTCAGGCGCAGCCCGGCAACGGCGGGATCGCAGCGCAGCACGCCGTTGCGGTAACGGGTTAGCGTGGCTATCACCTCACCCAGCGGTTTATCGCTGAAGCTCAGGATGTCCTTCGT > CP009273/4506675‑4506808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |