New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 4583141 = | NA (NA) | 7 (0.020) | 5/90 | NT | NA | intergenic (+12/+37) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter |
? | CP009273 | 4583171 = | NA (NA) | intergenic (+42/+7) | tsr/yjjL | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor/L‑galactonate transporter |
TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4583218‑4583141 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttatcgggcatAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC > CP009273/4583171‑4583235 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCT > 1:18817883/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGCCCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:13191640/1‑68 CCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTT > 1:17183972/1‑68 CTGGTTCGTCCGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:24458572/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:17775920/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:14683612/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:18082701/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:28589497/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA < 1:12893556/68‑1 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:24923141/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:5158193/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA > 1:10841035/1‑68 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA < 1:21774986/68‑1 CTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTA < 1:10399213/68‑1 TGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTAT < 1:4127597/68‑1 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTAgc > 1:23456777/1‑66 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:16860151/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:15854090/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:17417398/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:26876927/1‑68 GGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATC > 1:28068815/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:17621241/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:18559649/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:19893719/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:21920417/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:24157876/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:20478737/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:2164275/1‑68 TTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:17287571/1‑68 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TCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGG < 1:10152676/68‑1 TCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGG < 1:14981423/68‑1 TCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:9707964/1‑67 TCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGG > 1:13370613/1‑67 TCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCATATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGG < 1:2804039/68‑1 CGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCGCGATAACATTTTGCTTATCGGG < 1:751726/67‑1 CGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGC > 1:8951192/1‑68 CGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGC < 1:7594338/68‑1 TCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT > 1:24318170/1‑68 TCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT > 1:17427923/1‑68 CGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCATAAGGAGATTAAT < 1:10097724/68‑1 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ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:6136395/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:24467013/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:20941655/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC < 1:3071252/68‑1 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC < 1:3322133/68‑1 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC > 1:3957355/1‑68 ATCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTCGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCC < 1:13238693/68‑1 TCGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGTCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCA > 1:28914731/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:23957902/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:12464468/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:11153257/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:6554969/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:10552616/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:7082910/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:19052026/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:21954111/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:7822946/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:20135151/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:17405672/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:3595268/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:12471112/1‑68 CGGGCATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAG > 1:28358620/1‑68 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1:12956321/55‑1 ATAAGGAGATTAATCTTTAGGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC < 1:16786584/67‑1 ATAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC < 1:2124894/67‑1 TCCTGGTTCGTCAGCCGATCAACGACCCACGTAAAGATTAATCTCCTTATGCCCGATAACATTTTGCTTATCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4583218‑4583141 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttatcgggcatAAGGAGATTAATCTTTACGTGGGTCGTTGATCGGCTGACGAACCAGGAAGATGTACGCCAGTGCC > CP009273/4583171‑4583235 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |