| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1171843 | 291 (0.820) | 16 (0.050) +G |
5/110 | NT | 5.8% | coding (961/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein |
| ? | CP009273 | = 1171944 | 238 (0.670) | coding (1062/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein | |||||
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
GATCCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAAT > CP009273/1171776‑1171908 | gATCCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAgcg < 1:24247105/68‑1 (MQ=255) aTCCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGCGGCCAgcg > 1:13472599/1‑67 (MQ=255) ccTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCg > 1:12696698/1‑68 (MQ=255) cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:22288070/68‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:22963469/68‑1 (MQ=255) tGCAAACGCTAGGCTTAACTCCGCTACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCggg < 1:19261261/68‑1 (MQ=255) tGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCGTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCggg < 1:27907685/68‑1 (MQ=255) aaaCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGAtt < 1:16082043/68‑1 (MQ=255) aaaCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGAtt > 1:14098439/1‑68 (MQ=255) aaaCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGAtt > 1:17336558/1‑68 (MQ=255) aaaCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGAtt < 1:13754901/68‑1 (MQ=255) aaaCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGAtt > 1:20135879/1‑68 (MQ=255) cGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATc < 1:10206890/68‑1 (MQ=255) gCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGa < 1:29221126/62‑1 (MQ=255) gCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCg > 1:14721238/1‑68 (MQ=255) cTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGc < 1:25568208/66‑1 (MQ=255) cTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGc < 1:28027821/66‑1 (MQ=255) cTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGa > 1:145661/1‑68 (MQ=255) ttAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGAt < 1:10774011/68‑1 (MQ=255) ttAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGAt < 1:9313176/68‑1 (MQ=255) ttaCTCCGAGAATAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGGGCCGGGATTATCGGTGCGAt < 1:8239794/65‑1 (MQ=255) tAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGAt > 1:8926683/1‑67 (MQ=255) aaCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc < 1:9659098/68‑1 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:28683344/1‑67 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:19076255/1‑67 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:5940242/1‑67 (MQ=255) cTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTc > 1:19916692/1‑68 (MQ=255) cTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTc > 1:17021286/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:25184801/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:23623224/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:20812569/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:21551489/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:18049661/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:5099340/1‑68 (MQ=255) cgcgACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCCAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGa < 1:15117567/68‑1 (MQ=255) cgcgACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGa < 1:22555576/68‑1 (MQ=255) cgcgACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGa < 1:4953100/68‑1 (MQ=255) cAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcggc < 1:11456847/68‑1 (MQ=255) aTCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCt < 1:6885978/68‑1 (MQ=255) atgatgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTg > 1:21098295/1‑67 (MQ=255) gatgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgc > 1:9367280/1‑67 (MQ=255) atgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgcg > 1:28473760/1‑67 (MQ=255) atgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgcg > 1:19841718/1‑67 (MQ=255) atgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgcg > 1:16348559/1‑67 (MQ=255) ggTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgcgc > 1:698936/1‑66 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:20421445/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:1177418/67‑1 (MQ=255) tttATGGTGCACGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCt < 1:651203/68‑1 (MQ=255) attATCGTGCCCGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCt < 1:9127278/67‑1 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:667541/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:1199710/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:12502324/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:13886645/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:10353549/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGACCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:1279560/1‑67 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:23279111/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:7407187/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:27235143/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:1488552/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:4170553/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:3562701/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:26690463/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:15986116/1‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactg > 1:4358543‑M1/1‑17 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:3666400/1‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:7709043/1‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:17846170/1‑68 (MQ=255) gTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:15673084/1‑67 (MQ=255) gCAAGGGGCCAGCGccgcgccatcaagcaggacgccggttttcggcatcagattatttaactggcgg > 1:20756038‑M1/1‑14 (MQ=255) gCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcc < 1:10118681/68‑1 (MQ=255) gCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcc > 1:13203682/1‑68 (MQ=255) gCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcc > 1:19641785/1‑68 (MQ=255) gCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGCCGCCCTGCTTgccagcg > 1:23536420/1‑67 (MQ=255) gcaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:12812932/66‑1 (MQ=255) acggggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCCATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:5442697/65‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:28896662/67‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:8564253/67‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:11151254/67‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:16663423/67‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:6122637/67‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGccagccag > 1:7786169/1‑68 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:17696252/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:18272498/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:18609170/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:5299856/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:26012529/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:265469/68‑1 (MQ=255) ggggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGtt > 1:21932211/1‑68 (MQ=255) gggCCAGCGccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagc > 1:17633134‑M1/1‑9 (MQ=255) gggCCAGCGccgcgccatcaagcaggacgccgatgatcggcatcagattatttaactggctggcaagc > 1:4044487‑M1/1‑9 (MQ=255) gggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTa > 1:5630675/1‑68 (MQ=255) gggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTa > 1:26162291/1‑68 (MQ=255) gCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTaa < 1:12346896/67‑1 (MQ=255) gCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTaa < 1:27058671/67‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTaaa < 1:27453461/67‑1 (MQ=255) cgcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa > 1:12996182/1‑66 (MQ=255) cgcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa > 1:10633032/1‑66 (MQ=255) cgcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa > 1:18689476/1‑66 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataat < 1:8028974/66‑1 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataat < 1:14318098/66‑1 (MQ=255) | GATCCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAAT > CP009273/1171776‑1171908 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |