| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1171843 | 291 (0.820) | 16 (0.050) +G |
5/110 | NT | 5.8% | coding (961/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein |
| ? | CP009273 | = 1171944 | 238 (0.670) | coding (1062/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein | |||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
TGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGC > CP009273/1171878‑1172009 | tGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATggcgcgg < 1:2234573/68‑1 (MQ=255)tGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATggcgcgg < 1:13029113/68‑1 (MQ=255) ggCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATggcgcggc < 1:9345882/68‑1 (MQ=255) ggCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGGCCTGCTTGATggcgcggc < 1:17017483/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGc < 1:11702298/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGc < 1:24419407/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGGCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGc < 1:26164524/68‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATCATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGgcgctggccc > 1:4044487‑M2/1‑58 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGgcgctggccc > 1:869724‑M2/1‑58 (MQ=255) cTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGgcgctggccc > 1:19692059‑M2/1‑57 (MQ=255) tGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTAGATGGCGCGGCGCTGCCGGTg > 1:28554152/1‑67 (MQ=255) ccagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCt > 1:10062182/1‑68 (MQ=255) cagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCt < 1:17915532/67‑1 (MQ=255) cagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCt < 1:19778107/67‑1 (MQ=255) cagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCt < 1:22079296/67‑1 (MQ=255) gccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTGGATGGCGCGgcgctggccccttgcacc > 1:7368698‑M2/1‑50 (MQ=255) ccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCg > 1:28359384/1‑68 (MQ=255) cagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGgcgctggccccttgcacc > 1:28268985‑M2/1‑48 (MQ=255) cagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGgcgctggccccttgcacc > 1:4358543‑M2/1‑48 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:14512282/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:2798101/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:13783925/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:16320747/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:6026984/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:22868732/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:19010801/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGACCCt < 1:6392790/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:14027066/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:4470899/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:23547461/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:18628623/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:13329195/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:16897995/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:25220326/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:23764135/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:25121653/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:3048517/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:4724594/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:957288/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:21915936/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:15514935/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGAAAATCGGCGTCCTGCGTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:12509945/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATCCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:25460147/68‑1 (MQ=255) tAAATAAGCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:11123909/65‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:18922372/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:26723910/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:12654403/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:4126186/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:10897644/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:2991913/68‑1 (MQ=255) aataatCTCATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:7006177/68‑1 (MQ=255) ataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt > 1:15932096/1‑67 (MQ=255) ataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt > 1:20447302/1‑67 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:752961/1‑68 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:8381066/1‑68 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:9126331/1‑68 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTTATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:24010693/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:10475631/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:3189663/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:3580885/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:13725610/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:16539452/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:11319694/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:2077670/68‑1 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg > 1:9098210/1‑67 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGt < 1:1356426/68‑1 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGt < 1:6772993/68‑1 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGt < 1:7906126/68‑1 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGt < 1:21219877/68‑1 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGt < 1:23235776/68‑1 (MQ=255) gATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCa < 1:3656527/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:10069959/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:27774991/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:18298370/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:2414818/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:65667/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:17220091/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:12151257/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAt < 1:1757889/67‑1 (MQ=255) gCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTg > 1:25920673/1‑68 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:6098214/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:20953142/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:7809164/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:5832070/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTATACAGGTCATTGtt < 1:20741736/68‑1 (MQ=255) tCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTgcg < 1:5581940/68‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtggt < 1:27588359/68‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:28630112/67‑1 (MQ=255) gTCCTGATTGATGGCGCGGGGCTGCCGGTGGCTATCTAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:16216223/67‑1 (MQ=255) gCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGa < 1:23032867/68‑1 (MQ=255) 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TGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGC > CP009273/1171878‑1172009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |