| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2787742 = | 424 (1.200) | 27 (0.090) | 10/96 | NT | 7.7% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
| ? | CP009273 | 2787778 = | 287 (0.950) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter | |||||
Only 100 of 499 total aligned reads displayed.
GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTT > CP009273/2787711‑2787844 | gTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt < 1:23742635/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTa < 1:23523224/67‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:10050517/68‑1 (MQ=255) cGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTAc < 1:26015698/68‑1 (MQ=255) ggTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt > 1:17372607/1‑65 (MQ=255) ggTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCt > 1:17985830/1‑65 (MQ=255) tCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:9171280/68‑1 (MQ=255) gccAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggt < 1:13450340/67‑1 (MQ=255) atccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggt < 1:27567163‑M2/7‑1 (MQ=255) atccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagtaataccgccgggcTACtggt < 1:26761135‑M2/7‑1 (MQ=255) ccgcataatcataaccaccagtagcccggcgaacagataggccagaaataccgccgggcTACtggtgg < 1:28670157‑M2/9‑1 (MQ=255) ccgCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtg < 1:16997152/65‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:24642100/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:25955662/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:26897600/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:21140884/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:20688655/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:3005776/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:3680199/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:17143397/68‑1 (MQ=255) cAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACtggtgg < 1:9734756/68‑1 (MQ=255) gCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGtt > 1:16553458/1‑68 (MQ=255) gCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGtt > 1:25074983/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTGCTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:4954972/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:20289624/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:6943809/1‑68 (MQ=255) cGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTa > 1:15331050/1‑68 (MQ=255) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTggtggt < 1:11063218/65‑1 (MQ=255) gTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGtt < 1:28862929/66‑1 (MQ=255) ataatcataaccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACGGGGGGTTAt < 1:16249888‑M1/49‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:18880771/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATg < 1:24934409/67‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGa < 1:21007323/68‑1 (MQ=255) gCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGAt < 1:7207668/68‑1 (MQ=255) gCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGAt < 1:22261861/68‑1 (MQ=255) aTCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAt < 1:17764968/68‑1 (MQ=255) aTCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAt < 1:22809715/68‑1 (MQ=255) gCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAt < 1:13924678/65‑1 (MQ=255) ccaccagtaTCCCGGCGGGATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACGGGTGGGTTTGATTATGCgg < 1:5601713‑M1/59‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:26556532‑M1/59‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:4687609‑M1/59‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCgg < 1:2218094‑M1/59‑1 (MQ=255) ccaccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTAGCCGGGCTACTGGTGGTTTTGATTATGCgg < 1:27243958‑M1/59‑1 (MQ=255) caccagtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGa < 1:1026574‑M1/60‑1 (MQ=255) cGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGa > 1:1527320/1‑68 (MQ=255) aGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGt > 1:9365091/1‑68 (MQ=255) aGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGt > 1:29195272/1‑68 (MQ=255) aGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGt < 1:4167583/68‑1 (MQ=255) gCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGtt > 1:18592943/1‑68 (MQ=255) gtaGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTg < 1:23908308‑M1/65‑1 (MQ=255) gggCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTgg < 1:15796650/68‑1 (MQ=255) aGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGc < 1:19136999‑M1/67‑1 (MQ=255) CCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCgg < 1:842007‑M1/68‑1 (MQ=255) CCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCgg < 1:10503604‑M1/68‑1 (MQ=255) CCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGa < 1:4488488‑M1/68‑1 (MQ=255) tACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGtt > 1:14630173/1‑68 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGcc > 1:5175769/1‑68 (MQ=255) tGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGcc > 1:21623852/1‑68 (MQ=255) gCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCAc > 1:24813886/1‑68 (MQ=255) 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tACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGtt < 1:16696844/67‑1 (MQ=255) | GTCGGTTCCAGCGTCGCCATCGCCGAAGCGGGCCCGGCGGTATTACTGGCCTATCTGTTCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTT > CP009273/2787711‑2787844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |