New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 108768 = | 338 (0.820) | 18 (0.050) | 7/100 | NT | 5.5% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
? | CP009273 | 108799 = | 316 (0.850) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGG > CP009273/108799‑108865 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:9731608/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:8631870/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:21757572/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:13044083/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:6983182/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:18143527/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:31987467/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:32696234/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:32859703/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:15932617/1‑68 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCCGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:7865226/68‑1 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:24122314/68‑1 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:19931868/68‑1 ACCAGCGCCGTATTGACTCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:5944714/67‑1 ACCAGAGCCGTATTTAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:27143355/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCATTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:12465882/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:15750970/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:4247163/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:15958684/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:4401163/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:32440371/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:5981602/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:31747269/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:30085566/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:22017981/67‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:25066170/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:3502226/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:2791821/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:30025507/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:7889104/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:30093793/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:31372620/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:6979334/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:33625727/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:10284245/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:17333978/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGAGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:16321228/1‑68 GTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACT < 1:24642313/68‑1 ATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGC < 1:14100935/68‑1 GAAGCATTAATTCAGCAGTTACAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGA < 1:11211543/68‑1 GAACCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGA < 1:7461975/68‑1 TAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATG < 1:9510489/68‑1 aaTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:20935326/66‑1 ATTCAGCCGTAAACAGCGGCGGGGAGCGTATTAAATTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:22890973/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:27291518/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:100755/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:22656041/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:20847838/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCACCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:8362919/68‑1 ATTCACCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:34191162/68‑1 aAAAAGCGGCGGGCAGCGTATTAATTACCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:7836770/67‑1 TAAACGCGGCGGGGACCGTATTAATTTCCCCGCCGCTTTAAACTGCTTAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:15541025/68‑1 TAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:13399836/68‑1 TAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:14943417/68‑1 AAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAACGCTTCAATACGGCT < 1:9361369/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGATTTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:23726391/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15137194/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:27383360/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:22426415/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:22291474/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:6275620/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:31360002/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15915779/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15969723/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:16012188/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:2582734/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGT < 1:33792510/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:11144011/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:15642286/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:21479518/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:22647584/1‑67 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCAGGCCAAACCAGG > 1:14356940/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:24877844/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:27216615/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTACACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:26829779/1‑66 CGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTC < 1:13955888/67‑1 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCCCGCCAATCCAGGTCTG > 1:17705884/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:23809515/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATT‑ATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGG < 1:3169346/68‑1 CTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCTAGGTCTGG < 1:28069598/68‑1 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGG > CP009273/108799‑108865 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |