| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 108768 = | 338 (0.820) | 18 (0.050) | 7/100 | NT | 5.5% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
| ? | CP009273 | 108799 = | 316 (0.850) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer | |||||
Only 100 of 483 total aligned reads displayed.
AATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGGA > CP009273/108733‑108866 | aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCtt > 1:23023958/1‑68 (MQ=255)aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCtt > 1:33589763/1‑68 (MQ=255) cAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTa > 1:16340979/1‑68 (MQ=255) cAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTa > 1:33830107/1‑68 (MQ=255) gtattgaagcattaattcagcagttaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAAct < 1:24642313‑M2/8‑1 (MQ=255) aCGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTa > 1:12931445/1‑65 (MQ=255) cGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:514046/1‑67 (MQ=255) cGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:34131282/1‑67 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:7089660/1‑66 (MQ=255) attgaagcattaattcagcagttaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAActgc < 1:14100935‑M2/10‑1 (MQ=255) tCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAActgctg > 1:29666773/1‑68 (MQ=255) tCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAActgctg > 1:4252257/1‑68 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:9548691/68‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:6651122/68‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:9280656/68‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:30857721/68‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:13991764/68‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:18243895/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa > 1:26966484/1‑68 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa < 1:18010026/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa < 1:10048457/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa < 1:8179900/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa < 1:11223390/68‑1 (MQ=255) tCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAAt < 1:18805471/68‑1 (MQ=255) agcattaattcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGGTGAAt < 1:34191162‑M1/46‑1 (MQ=255) agcattaattcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAAt < 1:22656041‑M1/46‑1 (MQ=255) cACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAAtt > 1:312783/1‑68 (MQ=255) aCGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTa > 1:20517578/1‑68 (MQ=255) cGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTaa > 1:29822879/1‑68 (MQ=255) gCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAAt > 1:25288206/1‑68 (MQ=255) cAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAAt > 1:11466377/1‑67 (MQ=255) attcagcagttaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:20847838‑M2/22‑1 (MQ=255) tcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGGTTc < 1:7461975‑M1/55‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:13245239/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:13490086/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:5534875/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:15787314/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:29072068/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:17729594/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:24931716/66‑1 (MQ=255) tGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAt < 1:33158008/68‑1 (MQ=255) tGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAt < 1:18542945/68‑1 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATaa > 1:3925529/1‑67 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:8383405/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:10869744/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:31522059/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:17514637/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:24536374/1‑68 (MQ=255) taaacgcggcggggaccgtattaatttccccgccgcTTTAAACTGCTTAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:15541025‑M2/32‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:4913044/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:19846163/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:23575781/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:21066439/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:16024999/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:24147048/68‑1 (MQ=255) aaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCTGAATTAACGCTTCAATACGGct < 1:9361369‑M2/33‑1 (MQ=255) tACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGct < 1:22865646/67‑1 (MQ=255) GCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTgg > 1:2791821‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGt < 1:30085566‑M1/67‑1 (MQ=255) GGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGt > 1:4401163‑M1/1‑67 (MQ=255) GGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAATGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGt < 1:12465882‑M1/67‑1 (MQ=255) GCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCGGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTcc < 1:7865226‑M1/68‑1 (MQ=255) GCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCAc > 1:31987467‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCAc > 1:32696234‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCAc > 1:32859703‑M1/1‑68 (MQ=255) ggAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACg < 1:25916323/67‑1 (MQ=255) ggAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACg < 1:6121538/67‑1 (MQ=255) ggAAATTAATACGCGCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACg < 1:3797341/67‑1 (MQ=255) aaaTTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGcc < 1:21803630/67‑1 (MQ=255) ttAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGc > 1:3540706/1‑68 (MQ=255) ttAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGc > 1:32543357/1‑68 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCAc > 1:5894723/1‑67 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCAc > 1:27686605/1‑67 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACg < 1:2020174/68‑1 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACg < 1:8870279/68‑1 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACg < 1:2880704/68‑1 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACg < 1:28129209/68‑1 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGGTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:14981752/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCCCGCCAGGCACGcc > 1:12202600/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:30554941/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:28536448/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:25781434/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCACGCACGcc > 1:17226322/1‑68 (MQ=255) cGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCa < 1:14422828/68‑1 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa > 1:10176529/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa > 1:21563572/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa > 1:21299015/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa > 1:15313208/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa > 1:11706222/1‑68 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCCCGCCAGGCCCGCCatt > 1:19396065/1‑65 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAAt < 1:31137019/67‑1 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAAt > 1:29246299/1‑67 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGATTTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:23726391‑M2/62‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:27383360‑M2/62‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:22291474‑M2/62‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:15915779‑M2/62‑1 (MQ=255) ccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg > 1:27216615‑M2/5‑66 (MQ=255) ccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTACACGCCAGGCACGCCAATCCAgg > 1:26829779‑M2/5‑66 (MQ=255) ttttAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTgg < 1:3442489/67‑1 (MQ=255) ttttAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGGCTGGa < 1:8662268/68‑1 (MQ=255) | AATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGGA > CP009273/108733‑108866 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |