New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 442683 | 334 (0.810) | 31 (0.090) | 10/90 | NT | 9.2% | coding (479/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
? | CP009273 | = 442722 | 343 (1.030) | coding (440/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/442606‑442683 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctgcgccgcCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < CP009273/442722‑442657 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:13522881/68‑1 AAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:4561804/1‑66 AAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:7068613/1‑66 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:12198484/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:13877504/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:20033046/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:17721054/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:6429189/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:32754690/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:148321/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:26689182/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:8648408/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:25045831/1‑65 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:8662872/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:23606379/1‑67 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:2067667/67‑1 CATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:1583810/55‑1 AGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGAAAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGT > 1:17518808/1‑68 ATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGTTCGCTGCGCCGCCGGTGCTCGGCTACTGTGCGGTAA > 1:10419295/1‑67 ATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGCTCGCTGCGCCGCCGGGGCTCGGCGACGGTGCGGTAc > 1:10460160/1‑66 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTTACCGGTGAG > 1:11200889/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTACCCGGTGAG > 1:28698975/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:31699293/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:14031088/1‑68 AGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGT > 1:20526092/1‑67 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:25042091/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:7672510/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:13185944/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTAATGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:12795345/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTTACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:26078213/1‑68 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GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATTGCGGCGCAGCGATCCT > 1:8413534/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGCTCCT > 1:30997983/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:26687767/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:25415859/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:11894180/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:24882351/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:24679142/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:28518406/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:30516135/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:31597179/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:7640802/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:1622143/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:170887/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:4661592/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCCATCCT > 1:19671364/1‑65 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:10225767/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGAGCCTGCTG > 1:21686640/1‑67 GCGCCGCCGGTGATCGGCTTCTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:5503894/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:25666196/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:9833533/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:1422368/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:16514121/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:5009146/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:18474688/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:25457754/68‑1 CGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:6555381/67‑1 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:18817934/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:12738128/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:13002550/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:2311106/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:2270577/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:26339468/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:22676940/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:32716522/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |