| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2416060 = | 329 (0.790) | 16 (0.050) | 8/90 | NT | 5.4% | coding (874/894 nt) | yfcH | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase |
| ? | CP009273 | 2416107 = | 292 (0.880) | intergenic (+27/+21) | yfcH/yfcI | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase/transposase_31 family protein | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AAGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2416137‑2416060‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acatccgccagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTC > CP009273/2416107‑2416170 AAGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGA < 1:2819826/68‑1 AGCCACTCATCCTGTAACACCGGGAGTTCTCTGGCGGATGTTTGCTTTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:22717138/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:10335388/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:21513814/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:25456523/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:2606194/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:26326317/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:29996052/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:30727905/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:13554717/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:30802723/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:30836648/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:34403022/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:34440546/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:3755318/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:5698674/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:6110236/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:11382877/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:6169277/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:10110082/68‑1 AGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGCATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGAC < 1:14560825/68‑1 GCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACA > 1:25523600/1‑68 GCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACA > 1:91863/1‑68 GCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACA > 1:20714176/1‑68 GCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACA > 1:12504834/1‑68 CACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATC < 1:11003562/68‑1 CACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACAT < 1:22887765/67‑1 ACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCC < 1:6401459/68‑1 ACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCC < 1:25648402/68‑1 ACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCC < 1:7535411/68‑1 cacATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGAGGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCG < 1:16067965/65‑1 CTAATCCTTTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCG < 1:6148165/68‑1 CTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCG < 1:7081362/68‑1 CTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCG < 1:8537846/68‑1 TAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCG > 1:33812106/1‑67 TAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCG > 1:12431352/1‑67 ATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCAGATCAGCGAACGACATCCGCCA > 1:14530542/1‑68 ATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCA > 1:31360935/1‑68 ATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCA > 1:24709636/1‑68 ATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCA > 1:30775501/1‑68 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TCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAG < 1:20286711/68‑1 TCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAG < 1:12210281/68‑1 TCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAG < 1:13451825/68‑1 TCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCA > 1:30925031/1‑67 TCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCA > 1:20491033/1‑67 TCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCA > 1:8750779/1‑67 CCGGGAGTTAACTGGCGGATGTATGCGGTAAACCCCATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCG < 1:32145039/68‑1 CCGGGACTGAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACAACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCG < 1:31873059/68‑1 atTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGT < 1:1205243/65‑1 AGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGT < 1:34307738/67‑1 AGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGT < 1:3971938/67‑1 AGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGT < 1:27150285/67‑1 AGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGT < 1:16865188/67‑1 AGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGT < 1:22407277/67‑1 TAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACA < 1:21975110/68‑1 TAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTA < 1:417506/66‑1 ACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGG < 1:28412353/68‑1 ACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCACCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGG < 1:16514736/68‑1 TGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGA < 1:12381839/36‑1 TGGCGGAGGTTTGCTGTAAACCACTTGCGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGAT < 1:32952644/68‑1 CGGATGTTTGCTGTAAACCACATCCGCGAACGACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTA < 1:9160202/67‑1 CCACATCCGCCAACGACATCCGCCTGTTAACCCCCGGTGTTACAGCATTAGTGGCTTTGCGCGATAAG < 1:29463546/68‑1 ACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAG > 1:1772152/1‑68 ACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAG < 1:2959649/68‑1 ACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAG < 1:23229352/68‑1 CATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGT < 1:32892906/68‑1 CATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAG > 1:28631939/1‑67 CATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAG > 1:7958489/1‑67 CATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAG > 1:23325610/1‑67 CATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAG > 1:17048318/1‑67 CATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTG > 1:33887040/1‑37 TCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCG > 1:28478334/1‑68 TCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCG > 1:4229715/1‑68 TCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCG > 1:21763001/1‑68 CCGCCAGTTAACTCGCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGG < 1:8364697/68‑1 CCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGG < 1:18954282/68‑1 CGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTATTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTTGTGAAAGTCGGG < 1:16742880/68‑1 CGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGG < 1:5107262/68‑1 CGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGG < 1:25350602/68‑1 CGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGG < 1:25091771/68‑1 CGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGG < 1:2462009/68‑1 CGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGG < 1:10901897/68‑1 GCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGT < 1:33728831/68‑1 GCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGT < 1:14844639/68‑1 GCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGT < 1:17179699/68‑1 GCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGT < 1:21098618/68‑1 CCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTC > 1:27269568/1‑68 CCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTC > 1:20675821/1‑68 CAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTC > 1:4367943/1‑67 AAGCCACTAATCCTGTAACACCGGGAGTTAACTGGCGGATGTTTGCTGTAAACCACATCAGCGAACGACATCCGCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2416137‑2416060‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acatccgccagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTC > CP009273/2416107‑2416170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |