| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2416060 = | 329 (0.790) | 16 (0.050) | 8/90 | NT | 5.4% | coding (874/894 nt) | yfcH | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase |
| ? | CP009273 | 2416107 = | 292 (0.880) | intergenic (+27/+21) | yfcH/yfcI | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase/transposase_31 family protein | |||||
Only 100 of 483 total aligned reads displayed.
GGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTC > CP009273/2416040‑2416170 | ggTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCGAAGTTCCGCCAGt > 1:16316923/1‑68 (MQ=255)ggTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGt < 1:24691531/68‑1 (MQ=255) tgtaacaccgggagttaaCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTa < 1:21975110‑M1/50‑1 (MQ=255) tACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGtt < 1:10085854/67‑1 (MQ=255) aCGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTa > 1:2976643/1‑67 (MQ=255) cGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAAc < 1:28150901/68‑1 (MQ=255) gATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACt < 1:7455580/68‑1 (MQ=255) gATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACt < 1:11038483/68‑1 (MQ=255) tttAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTc > 1:12594879/1‑67 (MQ=255) tttAGAAGAGGCGCAGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTc > 1:11542157/1‑67 (MQ=255) tAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCg < 1:12157295/68‑1 (MQ=255) ccgggagttaactggcggatgtatgcggtaaaccccatcagcgaacgacatccgccagTTAACTCCCg < 1:32145039‑M2/10‑1 (MQ=255) aagaGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtg > 1:4750455/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:28423204/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:2862957/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:26841306/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:29386049/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:29614539/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:3078224/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:2374865/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:32470915/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:20114127/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:33281241/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:19200773/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:10242379/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:10573325/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:17660257/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:16211992/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:6614087/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:15123283/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:1454356/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:13811489/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:7894027/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:6398544/66‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:15891872/66‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:8220074/66‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGATTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:16799838/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGAGGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtg < 1:21479907/67‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCGGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:23420361/1‑68 (MQ=255) agttaactggcggatgtttgctgtaaaccacatcagcgaacgacatccgccagTTAACTCCCGgtgt < 1:3971938‑M2/14‑1 (MQ=255) agttaactggcggatgtttgctgtaaaccacatcagcgaacgacatccgccagTTAACTCCCGgtgt < 1:34307738‑M2/14‑1 (MQ=255) taactggcggatgtttgctgtaaaccacatcagcgaacgacatccgccagTTAACTCCCGGTGTTa < 1:417506‑M2/16‑1 (MQ=255) cgcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAg > 1:22486741/1‑68 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTTGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg < 1:9414342/68‑1 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg < 1:5049820/68‑1 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg < 1:27244017/68‑1 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg < 1:9809552/68‑1 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTGCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAg < 1:18023234/67‑1 (MQ=255) CTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGCTGTTACAGGa < 1:13349174‑M1/68‑1 (MQ=255) TGGCGGATGTCGTTCGTTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGAt > 1:16964560‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTAGAGGAt > 1:9196339‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGa > 1:30925031‑M1/1‑67 (MQ=255) TGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGAt > 1:31360935‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGAt > 1:22144868‑M1/1‑68 (MQ=255) CGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTAAAGGATTAg < 1:6148165‑M1/68‑1 (MQ=255) GGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGt < 1:25648402‑M1/68‑1 (MQ=255) ATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTg < 1:22887765‑M1/67‑1 (MQ=255) TGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGc > 1:25523600‑M1/1‑68 (MQ=255) TGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGc > 1:20714176‑M1/1‑68 (MQ=255) GTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCt < 1:5698674‑M1/68‑1 (MQ=255) tCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTgc > 1:21161576/1‑67 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:20587569/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:31857882/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:18657482/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:3711816/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:7014219/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg > 1:2999541/1‑68 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:20990981/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:7296758/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:27714027/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:27354618/68‑1 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg > 1:2427853/1‑68 (MQ=255) gCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGcgcg < 1:26277268/68‑1 (MQ=255) tGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGAt < 1:8624591/68‑1 (MQ=255) tgtgGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATaa < 1:33612606/67‑1 (MQ=255) tgtgGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAg > 1:14202898/1‑68 (MQ=255) ggTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGAt < 1:29178218/67‑1 (MQ=255) tttACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCg < 1:33102029/67‑1 (MQ=255) ttACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCg > 1:8862175/1‑66 (MQ=255) ttACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCg > 1:2896022/1‑66 (MQ=255) ttACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGt < 1:25960583/67‑1 (MQ=255) ttACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTc < 1:7659467/68‑1 (MQ=255) tACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCg > 1:18801925/1‑65 (MQ=255) aGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGt > 1:12373189/1‑68 (MQ=255) aGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGt > 1:13037060/1‑68 (MQ=255) aGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGt > 1:15480881/1‑68 (MQ=255) tcAAACTTCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTTCAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTgg < 1:3057996/65‑1 (MQ=255) gCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTg > 1:5244901/1‑68 (MQ=255) gCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTg > 1:2036758/1‑68 (MQ=255) aaaCATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTgg < 1:30250048/64‑1 (MQ=255) aaaCATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTgg < 1:1192677/64‑1 (MQ=255) aaaCATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTgg < 1:17918380/64‑1 (MQ=255) aaaCATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTgg < 1:19567955/64‑1 (MQ=255) aaaCATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGaa < 1:32813137/68‑1 (MQ=255) acatccgccagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAg < 1:23229352‑M2/57‑1 (MQ=255) catccgccagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTg > 1:33887040‑M2/11‑37 (MQ=255) tccgccagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCg > 1:21763001‑M2/9‑68 (MQ=255) cgccagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCggg < 1:25091771‑M2/62‑1 (MQ=255) gccagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGt < 1:17179699‑M2/63‑1 (MQ=255) cagTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTc > 1:4367943‑M2/4‑67 (MQ=255) | GGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGATTAGTGGCTTTGCGCGATAAGATCGTCTGGTGAAAGTCGGGTC > CP009273/2416040‑2416170 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |