New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2416060 = | 329 (0.790) | 16 (0.050) | 8/90 | NT | 5.4% | coding (874/894 nt) | yfcH | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase |
? | CP009273 | 2416107 = | 292 (0.880) | intergenic (+27/+21) | yfcH/yfcI | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase/transposase_31 family protein |
Only 100 of 425 total aligned reads displayed.
GCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGA > CP009273/2415995‑2416127 | gcgcgcTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTg < 1:26144904/68‑1 (MQ=255) gacccgactttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaccgggagttaaCTgg > 1:20675821‑M1/65‑68 (MQ=255) gcgcTGCCTAACCGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTgg < 1:29912100/67‑1 (MQ=255) gcgcTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTgg < 1:32784005/67‑1 (MQ=255) gcgcGGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTgg < 1:23539368/67‑1 (MQ=255) acccgactttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaccgggagttaaCTGGc < 1:17179699‑M1/5‑1 (MQ=255) cccgactttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaccgggagttaaCTGGCg < 1:5107262‑M1/6‑1 (MQ=255) cccgactttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaccgggagttaaCTGGCg < 1:25350602‑M1/6‑1 (MQ=255) ccgactttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaccgggagttaaCTGGCgg < 1:18954282‑M1/7‑1 (MQ=255) cgactttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaacgggagttaaCTGGCGGa > 1:16291873‑M1/61‑68 (MQ=255) tGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGGTTTGCGTTTCGCTGGGACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGa < 1:7207896/67‑1 (MQ=255) ctttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaccgggagttaaCTGGCGGATg > 1:28631939‑M1/58‑67 (MQ=255) ctttcaccagacgatcttatcgcgcaaagccactaatcctgtaacaccgggagttaaCTGGCGGATGt > 1:1772152‑M1/58‑68 (MQ=255) aaCGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGt > 1:941877/1‑67 (MQ=255) aCGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc < 1:27181826/68‑1 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:14522116/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:10192952/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:6417911/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:12578065/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:22660934/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:4378016/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:11643655/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:31880466/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:34140799/1‑67 (MQ=255) cGGCTGGAAGAAGCGGG‑TTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:4661953/1‑66 (MQ=255) gCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:15600401/1‑65 (MQ=255) gCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTc > 1:4943050/1‑65 (MQ=255) cTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTctct < 1:25885685/67‑1 (MQ=255) cTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCt < 1:9136632/67‑1 (MQ=255) tgtaagaagCGGGTTTTGCGTTTCGCTGTTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGa < 1:33748549/65‑1 (MQ=255) tGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAG‑GGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGa < 1:14293101/67‑1 (MQ=255) agaagCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGAtgt < 1:30384230/67‑1 (MQ=255) gaagCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg > 1:25023412/1‑68 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGCGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg < 1:33422247/66‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg < 1:22215538/66‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg < 1:26908268/66‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg < 1:5289122/66‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg < 1:21437823/66‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg < 1:3491887/66‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTgg < 1:12783283/66‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGt < 1:11434803/67‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGt < 1:12826880/67‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGt < 1:1327474/67‑1 (MQ=255) agCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGt < 1:23794392/67‑1 (MQ=255) gggTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCTCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGttt < 1:5493355/66‑1 (MQ=255) gggTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTAc < 1:18224213/68‑1 (MQ=255) ggtttGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGCGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACa < 1:6184617/65‑1 (MQ=255) ttttCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGc < 1:27890824/67‑1 (MQ=255) gCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAAc < 1:3990232/68‑1 (MQ=255) gCGTTTCGCTGGTAAGCTTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGCTGTGGTTTACAGCAAAc < 1:8797274/68‑1 (MQ=255) cactaatcctgtaacaccgggagttaaCTGGCGGATg > 1:33887040‑M1/28‑37 (MQ=255) tCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATcc > 1:7687637/1‑67 (MQ=255) tGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAg < 1:11802593/68‑1 (MQ=255) ggTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGt > 1:30800749/1‑68 (MQ=255) cctgtaacaccgggagttaaCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGt < 1:28412353‑M1/48‑1 (MQ=255) tgtaacaccgggagttaaCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTa < 1:21975110‑M1/50‑1 (MQ=255) tACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGtt < 1:10085854/67‑1 (MQ=255) tACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTa > 1:15982365/1‑68 (MQ=255) aCGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTa > 1:18797911/1‑67 (MQ=255) aCGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTa > 1:2976643/1‑67 (MQ=255) taacaccgggagttaaCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTa < 1:417506‑M1/50‑1 (MQ=255) tttAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTc > 1:26606321/1‑67 (MQ=255) tttAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTc > 1:19280103/1‑67 (MQ=255) tttAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTc > 1:3723234/1‑67 (MQ=255) ttAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTccc > 1:7484547/1‑68 (MQ=255) tAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCg < 1:3594862/68‑1 (MQ=255) tAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCg < 1:12157295/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGGCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:16714413/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:25182873/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:7894027/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:17659129/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:14999760/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:13811489/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:14202669/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:6786201/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:8081986/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:21767226/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:24794015/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:24615924/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:2309390/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:28125114/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:29152401/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:29614539/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:21132968/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt > 1:3155000/1‑68 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtgt < 1:32331352/68‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtg < 1:19772881/67‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgtg < 1:24119672/67‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:16837281/66‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:27333788/66‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:23302723/66‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:8220074/66‑1 (MQ=255) agagGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGgt < 1:32943720/66‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTa < 1:17088132/67‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTAc > 1:10376238/1‑68 (MQ=255) cgcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAg > 1:29346690/1‑68 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg < 1:20924770/68‑1 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAgg < 1:10664481/68‑1 (MQ=255) gcTGGCGGATGTCGTGCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAg < 1:18023234/67‑1 (MQ=255) CTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGa < 1:20286711‑M1/68‑1 (MQ=255) | GCGCGCTGCCTAAACGGCTGGAAGAAGCGGGTTTTGCGTTTCGCTGGTACGATTTAGAAGAGGCGCTGGCGGATGTCGTTCGCTGATGTGGTTTACAGCAAACATCCGCCAGTTAACTCCCGGTGTTACAGGA > CP009273/2415995‑2416127 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |