| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2724439 = | 360 (0.870) | 100 (0.280) +ACAGCTT |
7/98 | NT | 24.1% | noncoding (78/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA of rrnG operon |
| ? | CP009273 | 3422039 = | NA (NA) | noncoding (83/1542 nt) | rrsD | 16S ribosomal RNA of rrnD operon | |||||
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
TTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2724504‑2724439‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGTTTCCTGTTACCGTTCGACTTGCATGTGT > CP009273/3422039‑3422071 ||||||| TTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAAGGGTAACAGGAAAC > 1:33157252/1‑68TTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAAC > 1:20606730/1‑68TTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAAC < 1:1859401/68‑1TTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAAC > 1:2132656/1‑68TTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAAC > 1:28856172/1‑68 TGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA < 1:18879941/68‑1 GATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAG < 1:34162196/68‑1 GATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAG < 1:9308866/68‑1 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:30190812/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:19287414/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:19246001/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:24405150/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:32279943/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:25949353/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:4578488/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:1634460/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:29061729/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:8779847/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:34367158/1‑66 ATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACA > 1:13412903/1‑66 TCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCT > 1:15694368/1‑68 TCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCT > 1:14660335/1‑68 TCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCT > 1:17683097/1‑68 TCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCT > 1:26609675/1‑68 TCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGC < 1:2240175/67‑1 TCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGC < 1:25758501/67‑1 TCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGC < 1:19633062/67‑1 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCTGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT < 1:1077431/68‑1 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:23231753/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:25815808/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT < 1:6643218/68‑1 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:20780431/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:25323256/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:26901376/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:5615066/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:27910820/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:18443332/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:4207249/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:29514573/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:13928836/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:13617593/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:1257867/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:1070307/1‑68 CATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGACAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:14917161/1‑68 ATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTG < 1:1668567/68‑1 TGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGC < 1:4315240/68‑1 TGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGC < 1:1274608/68‑1 GGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCT < 1:7951129/68‑1 GGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCT < 1:19544670/68‑1 GGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCT < 1:8655943/68‑1 GGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCT < 1:28406293/68‑1 GGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCT < 1:31981822/68‑1 GGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCT < 1:12035386/68‑1 GCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:30671061/1‑64 GCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:5988606/1‑64 GCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:20146171/1‑64 GCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:30100369/1‑64 GCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:16122958/1‑64 GCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTT > 1:5144377/1‑64 GCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGACTAACACATGCAAGTCGAACGGTAAAAGGAAACAGCTT > 1:7056338/1‑64 CTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGT > 1:33311889/1‑68 CTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTG < 1:18353754/67‑1 CTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTG < 1:26799145/67‑1 TCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTT > 1:31104215/1‑68 TCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTT > 1:18008447/1‑68 TCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTT > 1:11298/1‑68 TCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTT > 1:5379333/1‑68 TCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTT > 1:14253373/1‑68 TCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTCGCTGTT > 1:25030301/1‑68 TCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAAAAGGAAACAGCTTGCTGTT > 1:24845468/1‑68 GATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:22246062/1‑67 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:5536603/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:9727939/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:8324561/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:8979007/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:10087510/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:33430258/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:13724689/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:18722419/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:21052564/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:21457013/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:23762141/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:24063916/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:33058991/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:31257526/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:29810359/1‑66 ATTGAACGCTGGCGGCACGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:14456222/1‑66 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTCCT < 1:10498432/67‑1 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:23636056/1‑65 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:5279451/1‑65 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:323432/1‑65 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC < 1:27123603/65‑1 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:28188270/1‑65 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC < 1:9124375/65‑1 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC < 1:9191943/65‑1 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:12084107/1‑65 TTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTC > 1:29727138/1‑65 CCTAACACATGCAAGCCGAACGGTAACAGGAAACAGCTTGCTGTTTCCTGTTACCGTTCGACTTGC < 1:6597834/66‑1 AACACATGCACGTCGACCGGCAACAGGAAACCGCTTGCTGTTTCCTGTTACCGTTCGACTTGCATGTG < 1:33820694/68‑1 AACACATGCAAGTCGACCGGTAACAGCAACCCGCTTGCTGTTTCCTGTTACCGTTCGACTTGCATGTG < 1:6803530/68‑1 ||||||| TTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGTAACAGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2724504‑2724439‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTGTTTCCTGTTACCGTTCGACTTGCATGTGT > CP009273/3422039‑3422071 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |