New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 2787742 = | 456 (1.100) | 33 (0.090) | 12/96 | NT | 8.1% | coding (131/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
? | CP009273 | 2787778 = | 356 (1.000) | coding (167/1401 nt) | gabP | gamma‑aminobutyrate transporter |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CATTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2787815‑2787742 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgggcTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCGGTTCGTT > CP009273/2787778‑2787844 CATTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCG < 1:23132597/68‑1 CATTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCG < 1:21931249/68‑1 CATTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCG < 1:20162821/68‑1 CATTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCG < 1:46999/68‑1 CATTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACC < 1:11552328/67‑1 CATTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACC < 1:11726005/67‑1 TTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCC < 1:19527888/68‑1 TTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCC < 1:8046584/68‑1 TTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCC < 1:6040038/68‑1 TTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCC > 1:11977969/1‑68 TTTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCC < 1:12515862/68‑1 TTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCG > 1:10776977/1‑68 TTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCG > 1:3101899/1‑68 TTCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCG > 1:32211648/1‑68 TCCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGG < 1:16313873/68‑1 cctCCAACATCCGCAAAATCATAACCACCAGTA‑T‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:15600751/65‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATCCCGCCGGG < 1:13948633/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:5461895/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:3796465/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:23887854/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:15470714/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:21389347/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:26705024/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:28008377/68‑1 CCGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:1170229/68‑1 CGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTAGG‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:11013178/68‑1 CGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑GCCCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:12947480/68‑1 CGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑GCCCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGG < 1:11013193/68‑1 CGCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGC < 1:16760183/68‑1 GCCAACATCCGCATAATCATACCCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATCCCGCCGGGCT < 1:9373343/68‑1 GCCAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCT < 1:29844844/68‑1 CAACATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTAC < 1:25388291/68‑1 ATCCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGAAAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGT < 1:25148215/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:25154578/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:5740956/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:15570160/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:21267476/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:1607730/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:1904901/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:18885388/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:12362420/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:6593032/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:31323792/68‑1 CCGCATAATCATAACCACCAGAA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:14524159/68‑1 CCGCATAATCAAAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:31453336/68‑1 CCGCATAATCAAAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGG < 1:1091279/68‑1 CGCATAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGT < 1:1644163/68‑1 GCATAATCAAAACCACCACTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTT < 1:10726056/68‑1 TAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATG < 1:6960230/68‑1 TAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATG < 1:11186139/68‑1 TAATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATG < 1:6227882/68‑1 AATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGA < 1:12460277/68‑1 ATCATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGAT < 1:8470238/68‑1 ATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAT < 1:16877486/68‑1 ATAACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTAT < 1:6124361/68‑1 AACCACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCACGTAAAACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGC < 1:25256090/68‑1 CACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGA < 1:28676513/68‑1 ACCAGTA‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGAT < 1:24164584/68‑1 tcG‑CCCGGCGACCCGATAGGCCAGTAATCCCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGG < 1:23073789/66‑1 A‑G‑CCCGGCGAACAGATAGGCCAGTAATACCGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGG < 1:19060843/67‑1 CGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCG > 1:18650870/1‑68 CGCCGGGCTACTGGTGGTTATGATTATGCGGATGTTGGCGGAAATGGCGGTTGCCACGCCCGATACCG > 1:33392219/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |